用Plot.ly制作微生物多样性交互式仪表板

资源摘要信息:"Plot.ly家庭作业-Belly Button生物多样性" - Plot.ly是一个用于创建交互式图表和数据可视化的网络应用程序。它允许用户利用内置工具和自定义选项来创建各种图表，包括条形图、折线图、散点图、热图、饼图、地图等。 - 在本次作业中，我们将使用Plot.ly来构建一个交互式仪表板，目的是探索与分析人脐微生物的分类多样性。通过这种方式，我们可以更好地了解人体内部微生物群落的构成。 - 数据集涉及到超过70%的人中存在的少量微生物物种，这些物种在研究中被称为操作分类单元（OTU）。OTU是一个微生物生态学中的术语，代表了一个或多个具有相似16S rRNA基因序列的微生物种群。 - 使用D3.js库来处理数据和绘制图表。D3.js（或简称D3）是一个JavaScript库，它让开发者能够使用数据驱动文档的方法来操作文档，从而实现数据的动态显示。 - 作业要求首先读取名为samples.json的文件。在JavaScript中，我们可以通过AJAX请求或fetch API来异步加载JSON数据。 - 创建水平条形图，它将展示特定个体中发现的前10个OTU。条形图的值（高度）将基于sample_values，条形图的标签（x轴）将基于otu_ids，并且每个条形将显示otu_labels作为悬浮文本，以提供额外的信息。 - 创建一个气泡图来显示样本数据。在气泡图中，x轴的值将基于otu_ids，y轴的值将基于sample_values，而气泡的大小将由sample_values决定，颜色也将根据otu_ids来确定。气泡图上的文本值将由otu_labels提供。 - 显示样本元数据，这通常指的是个体的个人信息，如年龄、性别、体重和健康状况等。 - 样本元数据需要在仪表板上的某个部分呈现，以便用户能够将微生物群落的数据与个体的人口统计信息相对应。 整体来看，这个作业将涉及到多个知识点： 1. Plot.ly的使用方法和交互式图表的创建。 2. D3.js在数据处理和图表绘制中的应用。 3. 对于JSON文件的读取、处理以及在前端的应用。 4. 水平条形图和气泡图的设计与实现。 5. 交互式图表中悬浮文本、颜色和大小等属性的定制。 6. 网页布局与前端交互设计，确保用户能够方便地与数据交互。 通过完成这项作业，学生不仅能够学习到如何使用Plot.ly和D3.js等工具，而且还能加深对微生物群落结构及其在人体健康中作用的理解。这在生物信息学、流行病学以及人类生态学研究中是一项非常有价值和实际应用的技能。