Mamba与Causal-Conv1D的whl安装包指南及性能优势

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0 下载量 4 浏览量 更新于2024-10-01 收藏 152.7MB ZIP 举报
资源摘要信息:"Mamba是一个高效、快速的包管理器，其设计目标是优化Conda的包管理和依赖关系处理，从而提供更加快速、稳定和简洁的环境管理体验。Mamba与Conda使用相同的包格式和生态系统，但其性能优化能够显著提升安装、升级和管理软件包的速度。例如，`mamba_ssm-1.0.1+cu118torch2.1cxx11abiFALSE-cp310-cp310-linux_x86_64.whl`文件就是Python 3.10的Mamba SSM模块的一个特定版本，它支持CUDA 11.8，兼容PyTorch 2.1，且适用于64位Linux系统。 Causal-Conv1D是一种特殊类型的1维卷积层，主要用于序列数据的处理，如时间序列分析或自然语言处理等。"

causal-conv1d-cuda.cp310-win-amd64.pyd

2024-06-04 上传
causal-conv1d-cuda 在Windows下对应的模块编译好的文件，参考博客Mamba 环境安装踩坑问题汇总及解决方法：https://blog.csdn.net/yyywxk/article/details/136071016

1.1.1版本的causal-conv1d、mamba-ssm源代码

2024-04-29 上传
1.1.1版本的causal-conv1d、mamba_ssm源代码，经过测试，该版本的causal-conv1d、mamba_ssm相互适配，能够满足Vmamba、MambaIR等算法的需求。注意：两个代码压缩包被压缩进了同一个压缩文件中，

mamba create -n celescope -y --file conda_pkgs.txt和conda create -n celescope -y --file conda_pkgs.txt结果有区别吗

2023-07-22 上传
`mamba create -n celescope -y --file conda_pkgs.txt`和`conda create -n celescope -y --file conda_pkgs.txt`这两个命令在功能上是相似的，都是用于创建一个名为"celescope"的conda环境，并从`conda_pkgs.txt`...

# 配置SNaQ主要环境 conda install -c conda-forge mamba conda create -n phylo python=3.8 conda activate phylo mamba install -c bioconda -c conda-forge raxml julia ## julia install_julia.jl wget http://pages.stat.wisc.edu/~ane/bucky/v1.4/bucky-1.4.4.tgz tar -zxvf bucky-1.4.4.tgz cd bucky-1.4.4/src make mv bucky ~/miniconda3/envs/phylo/bin/ mv mbsum ~/miniconda3/envs/phylo/bin/ cd ../.. wget http://research.haifa.ac.il/~ssagi/software/QMCN.tar.gz tar -zxvf QMCN.tar.gz mv find-cut-Linux-64 ~/miniconda3/envs/phylo/bin/find-cut-Linux-64 mv genTreeAndQuartets-Linux-64 ~/miniconda3/envs/phylo/bin/genTreeAndQuartets-Linux-64 mv quartet-agreement-Linux-64 ~/miniconda3/envs/phylo/bin/quartet-agreement-Linux-64 wget https://codeload.github.com/nstenz/TICR/zip/refs/heads/master unzip TICR-master.zip cd TICR-master/src make mv mdl ~/miniconda3/envs/phylo/bin/ cd ../.. conda deactivate # 配置mrbayes环境 ## 安装beagle提高运算效率 wget https://github.com/beagle-dev/beagle-lib/archive/refs/tags/v3.1.2.tar.gz tar -zxvf beagle-lib-3.1.2.tar.gz cd beagle-lib-3.1.2 ./autogen.sh ./configure --prefix=/usr make -j4 make install ## 安装mrbayes wget https://github.com/NBISweden/MrBayes/releases/download/v3.2.7/mrbayes-3.2.7.tar.gz tar -zxvf mrbayes-3.2.7.tar.gz cd mrbayes-3.2.7/ ./configure --prefix=/usr # mrbayes和beagle安装的位置必须能通过用户.bashrc直接调用，后续SNaQ的脚本批量执行时不能调用conda环境 make -j4 make install

2023-06-12 上传
首先，使用 conda 安装 mamba，并创建一个名为 phylo 的虚拟环境，并在该环境中安装 RaxML 和 Julia。然后，下载并安装 BUCKy 和 QMCN 软件包，将安装后的可执行文件移动到环境变量 PATH 中。接着，退出 phylo 虚拟...

安装mamba_ssm

2024-06-06 上传
如果你想安装Mamba SSM的特定版本，可以在`install`命令后面加上`-c conda-forge mamba-ssm-X.X.X`，替换`X.X.X`为实际的版本号。 5. 确认安装是否成功，输入： ``` mamba --version ``` 6. 如果你还需要安装...

mamba 安装Solving environment: failed with initial frozen solve. Retrying with flexible solve. Solving environment: -

2023-09-15 上传
mamba 安装时出现"Solving environment: failed with initial frozen solve. Retrying with flexible solve. Solving environment: -"错误信息通常表示在解决依赖关系时出现问题。为了解决这个问题，你可以尝试以下...

conda 安装snakemake

2023-08-15 上传
2. 使用conda安装mamba：conda install -c conda-forge mamba 3. 创建一个新的环境并安装snakemake：mamba create -n snakemake -c conda-forge -c bioconda snakemake 4. 激活snakemake环境：conda activate ...

conda如何使用sh安装mamba

2024-09-28 上传
在Conda环境中，如果你想要使用`sh`脚本来安装Mamba (它是conda的更快的替代品)，首先你需要确保已经安装了conda。然后可以创建一个新的shell环境，接着通过bash命令行安装Mamba。以下是步骤： 1. 打开终端或命令...

mamba 安装blast

2024-04-09 上传
2. 如果你还没有安装Mamba，你可以通过以下方式安装： ``` conda install -c conda-forge mamba ``` 3. 安装完成后，你可以使用以下命令来搜索BLAST的可用版本： ``` mamba search blast ``` 4. 选择适合你...

mamba创建虚拟环境设置python版本

2024-09-07 上传
1. 首先，确保已经安装了Mamba。如果没有，可以在终端或命令提示符中输入以下命令进行安装： ``` conda install -n base -c conda-forge mamba ``` 2. 创建新的虚拟环境并指定Python版本。例如，如果你想要创建...
小风飞子
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