第 38 卷 第 6 期
2010 年 6 月
西北农林科技大学学报(自然科学版)
Journal of Northwest A& F University(Nat .Sci .Ed .)
Vol .38 No .6
Jun .2010
秦 川 牛 G H 基 因 第 5 外 显 子 的 多 态 性 及 其
与 体 尺 性 状 的 关 联 性
倡 栘
胡怡菲
1
,昝林森
1 ,2
,王洪宝
1 ,2
,黄 磊
1
,钟 昕
1
,李常青
1
(1 西北农林科技大学 动物科技学院 ,陕西 杨凌 712100 ;2 国家肉牛改良中心 ,陕西 杨凌 712100)
[摘 要] 【目的】 研究秦川牛生长激素基因第 2 外显子的多态性 ,及其与部分体尺性状指标的相关性 。 【方
法】 以 502 头 2 周岁左右秦川牛为研究对象 ,利用 PCR‐RFLP 技术检测生长激素基因上存在的单核苷酸多态性
(SNPs) ,并分析其与秦川牛体尺性状的关联性 。 【结果】 在 G H 基因第 5 外显子中发现了 2 处 SNPs ,分别为错义突
变和同义突变 。 位点 1 经 A lu Ⅰ 酶切后 产生 AA 、AB 和 BB 3 种基因型 ,A 、B 等位基 因频率 分别为 0 .825 7 和
0 .174 3 ;卡方检测显示 ,该位点在所检测秦川牛群体中处于 Hardy‐Weinbery 不平衡状态 ;关联分析表明 ,该位点不同
基因型个体之间在体高 、胸围 、体斜长和尻长上差异显著 。 位点 2 经 A
f
l Ⅱ 酶切后产生 CC 和 CD 2 种基因型 ,C 和 D
等位基因的频率分别为 0 .902 4 和 0 .097 6 ;卡方检测显示 ,该位点在所检测秦川牛群体中处于 Hardy‐Weinbery 不平
衡状态 ;关联分析表明 ,该位点不同基因型个体间在腰角宽 、坐骨端宽和尻长上差异显著 。 第 5 外显子 2 个位点合并
基因型分析结果表明 ,双杂合基因型个体各体尺性状均显著高于其他基因型组合 ,并且多标记位点的组合效应高于
单标记位点 。 【结论】 组合 ABCD 各体尺性状数值均高于 AB 和 CD 基因型 ,组合 ABCD 可能是影响牛体尺性状的最
佳基因型组合 。
[关键词] 秦川牛 ;生长激素基因 ;PCR‐RFLP ;合并基因型
[中图分类号] S823 .8
+
12 [文献标识码] A [文章编号] 1671‐9387(2010)06‐0047‐09
Association between polymorphism of exon 5 in GH
g
ene and
p
artial body measurement traits in Qinchuan cattle
HU Yi‐fei
1
,ZAN Lin‐sen
1 ,2
,WANG Hong‐bao
1 ,2
,HUANG Lei
1
,
ZHONG Xin
1
,LI Chang‐
q
ing
1
(1 Colle
g
e o
f
A nimal Science and T echnolo
gy
,Nothwes t A & F Univ ersit
y
,Y an
g
lin g ,Shaanx i 712100 ,China ;
2 N ational Bee
f
Cattle I m
p
rovement Cente r ,Y an
g
ling ,Shaanx i 712100 ,China)
Abstract :【Objective】 The research was to study the relationship of the polymorphism in exon 5 of GH
g
ene on several body measurement traits in Qinchuan beef cattle .【Method】 502 Qinchuan cattles(Bos tar‐
urs) aged 2
y
ears were selected to detect polymorphism in exon 5 by using PCR‐RFLP ,and to study its as‐
sociations with Qinchuan cattle body measurement traits .【Result】 The result showed that two mutations
were found in exon 5 ,w hich were missense mutation and synonymous mutation .There were 3
g
enotypes
named AA ,AB and BB respectively after digestion by A lu Ⅰ .Allele frequency of A and B were 0 .825 7 and
0 .174 3 respectively .χ
2
test showed that the locus was not in Hardy‐Weinberg equlibrium in the Qinchuan
cattle population detected .Correlation analysis showed that individuals with different genotypes had signifi‐
倡
[收稿日期] 2009‐12‐17
[基金项目] 国家“863”高新技术研究与发展计划项目 (2006AA10Z1A1) ;国家“十一五”科技支撑 计划项目 (2006BAD01A10‐3 ) ;陕
西省 13115 科技创新专项 (2007ZDG /‐01)
[作者简介] 胡怡菲 (1985 - ) ,女 ,河南荥阳人 ,在读硕士 ,主要从事生物技术与动物生理调控研究 。 E‐mail :huyifei623@ 163 .com
[通信作者] 昝林森 (1963 - ) ,男 ,陕西扶风人 ,教授 ,博士 ,博士生导师 ,主要从事动物生长发育调控及牛遗传育种与繁殖研究 。
E‐mail :zanls@
y
ahoo .com .cn