MATLAB2012b版本下的PCA降维处理方法

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0 下载量 175 浏览量 更新于2024-10-02 1 收藏 669B ZIP 举报
资源摘要信息:"在MATLAB中实现主成分分析(PCA)降维" 主成分分析(PCA)是一种统计技术,它通过正交变换将一组可能相关的变量转换成一组线性不相关的变量,这些新变量被称为主成分。在机器学习和数据分析中,PCA常常被用来降低数据的维度,同时尽量保留数据的变异性。 PCA的关键步骤包括: 1. 数据标准化:由于PCA对数据的尺度非常敏感,因此通常需要先对数据进行标准化处理,使得数据具有零均值和单位方差。 2. 计算协方差矩阵:协方差矩阵反映了变量之间的协方差,是PCA分析的基础。 3. 求解特征值和特征向量:对协方差矩阵进行特征分解,得到特征值和对应的特征向量。特征值表示了数据在对应特征向量方向上的方差大小。 4. 排序特征值和特征向量:根据特征值的大小进行排序,特征值越大,对应的特征向量就越重要。 5. 选择主成分:根据实际需要选择前k个最大的特征值对应的特征向量,这k个特征向量构成了降维后的空间基。 6. 数据投影:将原始数据投影到选定的特征向量上,得到降维后的数据。 在MATLAB中,PCA的实现非常直接,因为MATLAB提供了内置的PCA函数和相关的数据处理工具。对于本压缩包中的“pca_process.zip_PCA实现降维_PCA降维MATLAB_pca_pca降维”文件,主要知识点集中在如何在MATLAB环境下编写和运行PCA降维代码。 以下是详细的步骤和概念,以供参考: 1. 数据预处理:在MATLAB中,首先需要准备或加载数据,然后根据需要对其进行预处理。常用的预处理方法包括去均值、标准化等。 2. 调用PCA函数:在MATLAB中,可以使用`pca`函数直接进行主成分分析。该函数的基本用法如下: ``` [coeff,score,latent] = pca(X) ``` 其中`X`是原始数据矩阵,`coeff`是特征向量矩阵,`score`是原始数据在主成分上的投影矩阵,`latent`是特征值向量,表示每个主成分的方差。 3. 设置降维参数:如果需要指定降维后保留的主成分数量,可以在`pca`函数中设置参数。例如: ``` [coeff,score,latent] = pca(X,0.95) ``` 上述代码会保留解释总方差95%的主成分。 4. 数据重构:在PCA降维之后,可以根据需要对数据进行重构,以查看降维对数据的影响。 5. 可视化:在PCA降维后,可以使用MATLAB的绘图功能来可视化数据。例如,可以绘制原始数据和降维后数据的散点图。 6. 应用场景:PCA降维在很多领域都有广泛的应用,例如图像处理、模式识别、数据压缩和特征提取等。 7. 注意事项:PCA降维在处理数据时可能会丢失一些信息,尤其是在降维到非常低的维度时。因此,选择合适的降维维度非常重要,通常需要结合具体问题来决定。 对于提供的文件“pca_process.zip_PCA实现降维_PCA降维MATLAB_pca_pca降维”,压缩包中包含的“pca_process.m”文件很可能是MATLAB脚本文件,用于实现上述PCA降维的处理过程。用户可以通过MATLAB编辑器打开和执行该脚本,以实现具体的降维任务。 以上就是关于“pca_process.zip_PCA实现降维_PCA降维MATLAB_pca_pca降维”的详细介绍。希望这些信息可以帮助理解PCA降维在MATLAB环境中的实现过程,并提供实际操作的指导。

优化这段代码 for j in n_components: estimator = PCA(n_components=j,random_state=42) pca_X_train = estimator.fit_transform(X_standard) pca_X_test = estimator.transform(X_standard_test) cvx = StratifiedKFold(n_splits=5, shuffle=True, random_state=42) cost = [-5, -3, -1, 1, 3, 5, 7, 9, 11, 13, 15] gam = [3, 1, -1, -3, -5, -7, -9, -11, -13, -15] parameters =[{'kernel': ['rbf'], 'C': [2x for x in cost],'gamma':[2x for x in gam]}] svc_grid_search=GridSearchCV(estimator=SVC(random_state=42), param_grid=parameters,cv=cvx,scoring=scoring,verbose=0) svc_grid_search.fit(pca_X_train, train_y) param_grid = {'penalty':['l1', 'l2'], "C":[0.00001,0.0001,0.001, 0.01, 0.1, 1, 10, 100, 1000], "solver":["newton-cg", "lbfgs","liblinear","sag","saga"] # "algorithm":['auto', 'ball_tree', 'kd_tree', 'brute'] } LR_grid = LogisticRegression(max_iter=1000, random_state=42) LR_grid_search = GridSearchCV(LR_grid, param_grid=param_grid, cv=cvx ,scoring=scoring,n_jobs=10,verbose=0) LR_grid_search.fit(pca_X_train, train_y) estimators = [ ('lr', LR_grid_search.best_estimator_), ('svc', svc_grid_search.best_estimator_), ] clf = StackingClassifier(estimators=estimators, final_estimator=LinearSVC(C=5, random_state=42),n_jobs=10,verbose=0) clf.fit(pca_X_train, train_y) estimators = [ ('lr', LR_grid_search.best_estimator_), ('svc', svc_grid_search.best_estimator_), ] param_grid = {'final_estimator':[LogisticRegression(C=0.00001),LogisticRegression(C=0.0001), LogisticRegression(C=0.001),LogisticRegression(C=0.01), LogisticRegression(C=0.1),LogisticRegression(C=1), LogisticRegression(C=10),LogisticRegression(C=100), LogisticRegression(C=1000)]} Stacking_grid =StackingClassifier(estimators=estimators,) Stacking_grid_search = GridSearchCV(Stacking_grid, param_grid=param_grid, cv=cvx, scoring=scoring,n_jobs=10,verbose=0) Stacking_grid_search.fit(pca_X_train, train_y) var = Stacking_grid_search.best_estimator_ train_pre_y = cross_val_predict(Stacking_grid_search.best_estimator_, pca_X_train,train_y, cv=cvx) train_res1=get_measures_gridloo(train_y,train_pre_y) test_pre_y = Stacking_grid_search.predict(pca_X_test) test_res1=get_measures_gridloo(test_y,test_pre_y) best_pca_train_aucs.append(train_res1.loc[:,"AUC"]) best_pca_test_aucs.append(test_res1.loc[:,"AUC"]) best_pca_train_scores.append(train_res1) best_pca_test_scores.append(test_res1) train_aucs.append(np.max(best_pca_train_aucs)) test_aucs.append(best_pca_test_aucs[np.argmax(best_pca_train_aucs)].item()) train_scores.append(best_pca_train_scores[np.argmax(best_pca_train_aucs)]) test_scores.append(best_pca_test_scores[np.argmax(best_pca_train_aucs)]) pca_comp.append(n_components[np.argmax(best_pca_train_aucs)]) print("n_components:") print(n_components[np.argmax(best_pca_train_aucs)])

2023-07-14 上传

把这段代码的PCA换成LDA:LR_grid = LogisticRegression(max_iter=1000, random_state=42) LR_grid_search = GridSearchCV(LR_grid, param_grid=param_grid, cv=cvx ,scoring=scoring,n_jobs=10,verbose=0) LR_grid_search.fit(pca_X_train, train_y) estimators = [ ('lr', LR_grid_search.best_estimator_), ('svc', svc_grid_search.best_estimator_), ] clf = StackingClassifier(estimators=estimators, final_estimator=LinearSVC(C=5, random_state=42),n_jobs=10,verbose=1) clf.fit(pca_X_train, train_y) estimators = [ ('lr', LR_grid_search.best_estimator_), ('svc', svc_grid_search.best_estimator_), ] param_grid = {'final_estimator':[LogisticRegression(C=0.00001),LogisticRegression(C=0.0001), LogisticRegression(C=0.001),LogisticRegression(C=0.01), LogisticRegression(C=0.1),LogisticRegression(C=1), LogisticRegression(C=10),LogisticRegression(C=100), LogisticRegression(C=1000)]} Stacking_grid =StackingClassifier(estimators=estimators,) Stacking_grid_search = GridSearchCV(Stacking_grid, param_grid=param_grid, cv=cvx, scoring=scoring,n_jobs=10,verbose=0) Stacking_grid_search.fit(pca_X_train, train_y) Stacking_grid_search.best_estimator_ train_pre_y = cross_val_predict(Stacking_grid_search.best_estimator_, pca_X_train,train_y, cv=cvx) train_res1=get_measures_gridloo(train_y,train_pre_y) test_pre_y = Stacking_grid_search.predict(pca_X_test) test_res1=get_measures_gridloo(test_y,test_pre_y) best_pca_train_aucs.append(train_res1.loc[:,"AUC"]) best_pca_test_aucs.append(test_res1.loc[:,"AUC"]) best_pca_train_scores.append(train_res1) best_pca_test_scores.append(test_res1) train_aucs.append(np.max(best_pca_train_aucs)) test_aucs.append(best_pca_test_aucs[np.argmax(best_pca_train_aucs)].item()) train_scores.append(best_pca_train_scores[np.argmax(best_pca_train_aucs)]) test_scores.append(best_pca_test_scores[np.argmax(best_pca_train_aucs)]) pca_comp.append(n_components[np.argmax(best_pca_train_aucs)]) print("n_components:") print(n_components[np.argmax(best_pca_train_aucs)])

2023-07-22 上传