使用OpenCPU进行嵌入式科学计算与可重复研究

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"R包opencpu是一个用于嵌入式科学计算和可重复研究的系统。它提供了一个基于R的可靠且互操作的HTTP API,用于数据分析。" `opencpu`包是R语言中一个重要的工具,主要用于构建可嵌入的科学计算环境和实现科研结果的可重复性。该包的核心功能是通过HTTP API开放R的计算能力,使得用户可以通过网络调用R的函数进行数据分析,从而实现远程计算和跨平台交互。 包作者Jeroen Ooms维护了这个项目,其最新版本为2.0.3,发布日期为2017年6月25日。`opencpu`包遵循Apache License 2.0开源协议,并提供了详细的在线文档和开发资源链接。在遇到问题时,用户可以通过GitHub上的Issue追踪系统报告bug。 依赖关系方面,`opencpu`包需要R版本至少为3.0.0,同时依赖多个R包,如`evaluate`、`httpuv`、`knitr`、`jsonlite`等,这些包对于构建和运行HTTP服务、代码评估、Markdown渲染和JSON数据处理至关重要。此外,`devtools`用于包的开发,`sys`、`webutils`、`curl`和`sendmailR`则支持系统级功能和网络通信,而`zip`、`mime`、`protolite`、`brew`、`openssl`则涉及压缩、MIME类型处理和加密安全。 `opencpu`包还支持一些可选的建议包,如`unix`、`haven`、`feather`、`pander`、`R.rsp`,它们可以提供额外的功能,比如Unix系统接口、数据导入导出、数据格式转换以及更友好的数据呈现。 该包的一个显著特性是其Vignette构建器,支持`knitr`和`R.rsp`,这意味着可以使用这两种工具创建和渲染包含R代码和输出的文档,这对于教学和文档编写非常有用。 系统要求中提到,`pandoc`是必要的,用于文档转换,而`apparmor`则是可选的,用于增强安全性。这表明`opencpu`包不仅关注计算能力,还重视系统的安全性和文档的灵活性。 `opencpu`是一个强大的工具,它使得R语言的数据分析能力能够无缝集成到Web应用和服务中,为统计服务和R Web应用提供了稳定的基础。通过使用`opencpu`,开发者和研究人员可以在分布式环境中轻松地复现、分享和部署他们的R代码,促进科研成果的透明度和可重复性。