MAPMAKER3.0基因定位教程：从数据整理到运行软件

"mapmaker 中文使用说明，内容详尽" MapMaker是一款广泛应用于基因定位的软件，尤其在植物遗传学研究中非常常见。本文档将详细介绍如何使用MapMaker 3.0版本进行数据整理和软件操作。 首先，数据整理是MapMaker运行前的关键步骤。在F2定位群体中，假设我们需要定位的基因为隐性，因此对不同标记的带型进行赋值。在Excel表格中，列出所有多态标记（例如：rm472、rm1139、rm11996、rm1387、rm1），并根据显性(a)、杂合(h)和隐性(b)带型分配数值。此外，添加一个特殊的“G”标记，代表目标基因，其赋值与隐性纯合体带型一致。完成整理后，将表格转置并在每个标记前加上“*”，同时在文件开头注明标记数量和定位群体株数，保存为RAW格式。 接下来，运行MapMaker 3.0软件。确保已将整理好的数据文件（例如：“dw.raw”）与软件保存在同一文件夹内。软件启动后，按照以下步骤操作： 1. 输入“pd”，然后按空格键，接着输入文件前缀名（例如：“dw”），回车。 2. 输入“photoxt”，其中“xt”是保存的文件名，回车。 3. 输入“unitcm”，设置单位为厘米，回车。 4. 输入“centfunckosambi”，选择Kosambi遗传距离计算方法，回车。 5. 输入“s{123456}”，这里的数字表示标记个数，回车。 6. 输入“group”，开始进行标记分组，回车。 每一步都将导向软件的不同界面，逐步进行基因连锁分析。MapMaker 3.0会基于输入的数据进行计算，生成连锁图谱，帮助研究人员识别和定位目标基因。 MapMaker 3.0的使用流程主要包括数据预处理和软件交互操作。正确整理数据和遵循软件指令是成功进行基因定位的基础。通过熟练掌握这些步骤，用户可以高效地利用MapMaker进行遗传图谱构建和基因定位研究。