NCBI BLAST 2.12.0+ Linux版本发布

由美国国家生物技术信息中心（National Center for Biotechnology Information，NCBI）开发，用于查找具有共同祖先的序列片段，即寻找序列之间的相似性。BLAST广泛应用于分子生物学和基因组学领域，是研究者分析序列相似性和功能保守区域的重要工具。 BLAST 2.12.0是BLAST软件包的一个版本，适用于x64架构的Linux操作系统。在该版本中，开发者对之前的版本进行了性能优化和新功能的增加。BLAST的最新版本通常会包含对程序核心算法的改进，对用户界面的优化，以及对各种数据库兼容性的提升。 BLAST的主要功能包括： 1. 序列比对（Alignment）：BLAST能够将查询序列与目标数据库中的序列进行比对，找出局部区域具有高度相似性的序列片段。比对结果会输出为一系列的对齐序列和它们的相似性得分。 2. 统计显著性评估（Statistical Significance）：BLAST通过计算E值（Expectation value）来评估找到的相似性是偶然发生的概率，帮助研究者判断这些相似性是否具有生物学意义。 3. 数据库搜索（Database Search）：用户可以使用BLAST搜索各种生物序列数据库，例如NCBI的NR（非冗余蛋白质序列数据库）等，以查找具有相似功能或进化关系的序列。 4. 多种BLAST类型：包括但不限于blastp（蛋白质查询蛋白质数据库），blastn（核酸查询核酸数据库），blastx（核酸查询蛋白质数据库，通过翻译的方式）， tblastn（蛋白质查询翻译后的核酸数据库），以及tblastx（通过双方翻译进行核酸与核酸的比较）。 5. 参数定制：用户可以根据自己的需求设置各种搜索参数，比如匹配和不匹配的得分，开放和扩展间隙的惩罚值等，以优化搜索结果。 6. 可视化工具：BLAST结果可以通过多种可视化工具查看，例如NCBI的BLAST网页版提供了一个直观的界面来显示比对结果。 对于生命科学领域的研究者而言，BLAST软件是一个必不可少的工具。它帮助研究者在海量的生物序列数据中快速找到相关的信息，对于基因注释、进化关系分析、功能预测等方面具有重大作用。BLAST的命令行工具需要用户对相关参数有所了解，才能高效地使用这一工具进行科学探究。 本压缩包ncbi-blast-2.12.0+-x64-linux.tar.gz包含了适用于64位Linux操作系统的BLAST 2.12.0软件。用户解压后，可以根据文件夹中的安装说明进行软件的安装和配置，安装完毕后即可在命令行中使用BLAST工具进行序列分析。 为了正确安装和使用BLAST，用户可能需要对Linux操作系统有一定的了解，包括对命令行的基本操作、文本处理工具的使用，以及对生物信息学基本概念的理解。此外，用户可能还需要安装一些必要的依赖软件和库文件，以保证BLAST软件的正常运行。 BLAST的官方站点通常提供详细的使用手册、FAQ和示例数据集，这对于用户学习和掌握BLAST工具的使用大有裨益。研究者应该定期查阅BLAST的更新日志，以了解新版本中引入的改进和新增功能，从而更好地利用这一强大的生物信息学工具。"