miRBase：详解特定miRNA的详细信息与功能

miRBase是一个专门针对microRNA（miRNA）的数据库，它提供了关于这些非编码小RNA分子的全面信息，对科学研究具有重要价值。miRNA是长度约为22核苷酸的RNA分子，在真核生物和多种细胞类型中普遍存在，参与基因表达调控，尤其是在动植物生长发育、细胞凋亡和疾病过程中起着关键作用。 miRBase的核心功能包括： 1. **miRNA注册**：miRBase接收并整合研究者提交的miRNA序列数据，采用Fasta格式，确保所有信息的准确性和完整性。这些序列会被添加到miRBaseSequenceDatabase中。 2. **miRNA搜索**：用户可以根据miRNA的名称、物种、序列特征等进行检索，方便查找特定miRNA的相关信息。 3. **特定miRNA具体信息**：数据库包含每个miRNA的详细信息，如茎环结构（Accession、ID、Description、Stem-loop结构等），深测序数据、基因上下文、基因家族关联，以及成熟序列（包括序列、克隆验证、北方分析、 Solexa测序结果等）。这些信息有助于理解miRNA的生物学功能和靶基因。 4. **miRNA靶标预测**：miRBase不仅提供已知的靶标信息，还包含了通过不同软件预测的潜在靶基因，便于科研人员进行进一步的研究。 5. **数据下载**：miRBase的所有数据可以通过Download page或FTP站点获取，方便用户在实验和研究中使用。 miRBase数据库的结构包括三个部分：miRBase数据库本身，miRBaseRegistry用于管理miRNA注册信息，以及miRBaseTargets数据库，现已更名microcosm并托管于欧洲生物信息学研究所（EBI）。通过这个全面的资源，研究人员可以深入理解miRNA的结构特性、功能机制及其在生命过程中的作用，从而推动相关领域的研究进展。