FgHtf1转录因子调控的禾谷镰刀菌基因表达研究

0 下载量 159 浏览量 更新于2024-09-09 收藏 817KB PDF 举报
"禾谷镰刀菌Homeobox转录因子FgHtf1敲除突变体基因差异表达分析" 文章探讨了禾谷镰刀菌(Fusarium graminearum)中一个重要的转录因子FgHtf1的功能。禾谷镰刀菌是一种导致小麦赤霉病的病原真菌,其分生孢子在感染过程中起到关键作用。研究人员通过先前的工作发现,FgHtf1特异性地调控分生孢子的形成。为了更深入地了解FgHtf1转录因子调控的基因网络,他们利用高通量RNA测序技术(RNA-Seq)对比了野生型PH-1菌株和FgHtf1敲除突变体(ΔFghtf1)的基因表达差异。 测序结果显示,共有591个基因在ΔFghtf1突变体中呈现上调表达,而549个基因表达下调。这些差异表达的基因被进一步分类和功能注释,以揭示它们在不同生物学过程中的可能作用。上调基因中有大约30%与新陈代谢和能量转运相关,6.7%参与细胞周期调控,0.9%参与发育路径,还有3%涉及细胞分化。下调基因中,约22%与新陈代谢和能量转运有关,3.8%影响细胞周期,2.2%参与细胞分化。 为了验证RNA-Seq的结果,研究团队选择了10个表现出显著上调、中度变化和微弱变化的基因进行实时荧光定量PCR(qPCR)检测,结果与RNA-Seq数据一致。接着,他们选取了两个表达明显下降的基因FGSG_10565和FGSG_07629,通过同源重组方法进行了基因敲除。然而,ΔFGSG_10565和ΔFGSG_07629突变体在菌落生长和产孢能力上没有显示出显著的差异,这表明这两个基因的生物学功能可能并不直接依赖于FgHtf1的调控。 这一研究揭示了FgHtf1转录因子在禾谷镰刀菌中调控的重要基因网络,为理解该病原真菌的致病机制提供了新见解。此外,通过基因敲除实验,研究者还强调了即使某些基因的表达受到FgHtf1的影响,它们的功能可能还有其他调控机制。这些发现对于未来开发控制小麦赤霉病的新策略具有重要意义。