EM算法应用:ABO血型等位基因概率估计

需积分: 16 5 下载量 37 浏览量 更新于2024-07-10 收藏 1.7MB PPT 举报
"EM算法实例ABO血型等位基因概率-EM算法案例" EM算法是一种统计学中的迭代方法,常用于含有隐藏变量的概率模型参数估计。在本案例中,我们将探讨EM算法如何应用于ABO血型等位基因概率的估计。 **I. 极大似然估计(MLE)** 极大似然估计是参数估计的一种常用方法,其目标是找到一组参数,使得给定观测数据出现的概率最大。在给定的例子中,老师给四个小朋友分糖,每个小朋友获得糖的数量有不同的概率。通过观察实际得到糖果的数目,我们可以使用极大似然估计来确定老师分糖时的偏爱程度,即参数μ。 **II. EM算法原理** EM算法全称为期望最大化(Expectation-Maximization),它包含两个主要步骤:E步(期望步骤)和M步(最大化步骤)。E步是计算隐藏变量的期望值,基于当前的参数估计;M步则是更新参数,使其最大化在E步中计算出的期望值。这两个步骤交替进行,直到参数估计的改变非常小或者达到预设的迭代次数,算法停止。 **III. EM算法实例:ABO血型等位基因概率** 在ABO血型系统中,有A、B、AB和O四种血型,它们由两种等位基因IA、IB和i控制。每个人有两个等位基因,可能是相同的(纯合子)或不同的(杂合子)。例如,AA、AO、BB、BO、AB和ii分别代表纯合A型、A型与O型杂合、纯合B型、B型与O型杂合、AB型和纯合O型。在没有直接观测到个体具体等位基因的情况下,EM算法可以帮助我们估计人群中各种等位基因频率。 **IV. EM算法实例1:混合高斯模型** 混合高斯模型是EM算法的一个经典应用,其中数据可能来自多个高斯分布的混合,而这些分布的权重(混合比例)和参数(均值和方差)是未知的。EM算法可以用来估计这些参数。 **V. EM算法实例2:Bayes后验众数** 在贝叶斯统计中,EM算法可以用来寻找后验概率密度函数的最大值,即后验众数。这种方法常用于在存在隐藏变量的情况下进行参数估计。 **VI. EM算法实例3:ABO血型等位基因概率估计** 在ABO血型系统中,我们可能只知道每个人的血型,而不了解他们的具体等位基因组合。EM算法可以通过迭代过程,逐步更新等位基因频率的估计,最终得出更精确的估计值。 例如,如果已知一个群体中A型、B型、AB型和O型血的人数,但不知道每个人的等位基因信息,EM算法可以帮助我们估算IA、IB和i等位基因的频率。首先,随机设定等位基因频率的初始值,然后在E步中计算每个血型条件下等位基因的期望频率,在M步中更新这些频率,重复这个过程直到收敛。 **R软件实现** 在R语言中,可以编写代码来执行EM算法。例如,初始化随机的μ值,然后在循环中不断迭代,每次迭代都更新b的值,直到满足停止条件,如连续两次迭代间μ的变化小于某个阈值。这个过程将不断优化μ的估计,直到找到一个最佳解。 通过以上案例,我们可以看到EM算法在处理隐藏变量问题上的强大能力,无论是分糖问题还是血型概率估计,都能有效地进行参数估计,揭示隐藏在数据背后的模式。

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