甘蔗丝氨酸/苏氨酸激酶基因的克隆和序列分析研究
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更新于2024-09-03
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"甘蔗丝氨酸/苏氨酸激酶基因的克隆及序列分析"
本研究论文主要介绍了甘蔗丝氨酸/苏氨酸激酶基因的克隆及序列分析。该研究使用福农28甘蔗品种为实验材料,电子克隆设计引物,克隆得到了甘蔗STK基因的cDNA片段。采用RACE技术克隆获得到了甘蔗叶STK基因cDNA的5'及3'端序列,长度分别为750bp和1000bp。5',3'端序列与中间片段重叠延伸后总片段长为1364bp,其中5'UTR为54bp,3'UTR为485bp,包含完整的0RF为825bp,共编码274个氨基酸。
在序列分析中,使用Open Reading Frame Finder确定其为丝氨酸/苏氨酸激酶,通过预测该蛋白质分子质量为29.9052ku,理论等电点为6.36。将其基因序列与NCBI中其它植物的STK进行比对,发现与高粱、玉米、水稻、短柄草、大麦的相似性分别为97%,94%,89%,89%,88%。
该研究的结果表明,甘蔗STK基因的克隆和序列分析对于了解甘蔗的生理和生物化学过程非常重要。同时,本研究也为甘蔗育种和基因工程提供了重要的参考依据。
知识点:
1. 甘蔗STK基因的克隆:使用电子克隆设计引物和RACE技术克隆获得甘蔗STK基因的cDNA片段。
2. 序列分析:使用Open Reading Frame Finder确定其为丝氨酸/苏氨酸激酶,并预测该蛋白质分子质量和理论等电点。
3. 基因序列比对:将甘蔗STK基因序列与NCBI中其它植物的STK进行比对,发现与高粱、玉米、水稻、短柄草、大麦的相似性。
4. 甘蔗生理和生物化学过程:甘蔗STK基因的克隆和序列分析对于了解甘蔗的生理和生物化学过程非常重要。
5. 甘蔗育种和基因工程:该研究为甘蔗育种和基因工程提供了重要的参考依据。
6. 电子克隆设计引物:使用电子克隆设计引物克隆甘蔗STK基因的cDNA片段。
7. RACE技术:使用RACE技术克隆获得甘蔗叶STK基因cDNA的5'及3'端序列。
8. 序列分析软件:使用Open Reading Frame Finder确定其为丝氨酸/苏氨酸激酶。
9. 基因序列比对工具:使用NCBI中其它植物的STK进行比对,发现与高粱、玉米、水稻、短柄草、大麦的相似性。
10. 甘蔗基因工程:该研究为甘蔗基因工程提供了重要的参考依据。
2021-05-22 上传
2021-05-16 上传
2022-04-16 上传
2021-06-11 上传
2021-05-26 上传
2021-04-27 上传
2020-02-22 上传
2021-05-25 上传
2020-03-10 上传
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