Shelxtl 5:结构分析软件详解,五大工具与数据文件详解
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更新于2024-08-24
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Shelxtl 5是一款功能强大的结构分析软件,由Sheldrick G.M.在德国哥廷根大学开发,主要版本包括Shelx86、Shelx93、Shelx97和SHELXTL5系列。该软件适用于多种操作系统,如MSDOS、UNIX以及Windows NT,特别适合在实验室环境下使用。其软件结构清晰,包含五个核心组件:XPREP、XS、XP、XL和XCIF,分别负责数据预处理、结构解释、结构图形、结构修正和结构报告。
数据管理是Shelxtl 5的重要部分,它支持多种文件类型,如name.ext,其中ext标识不同的文件类别。主要的文件包括衍射数据文件(name.hkl,ASCII格式,如00136.571.311、003112.064.071等)、指令文件(name.ins)和结果文件(name.res),这些文件均采用四字符字符串定义的指令集格式。衍射点文件存储了实验测量的结晶数据,如hkl坐标和强度信息。
SADABS模块是Shelxtl 5中的关键工具,用于数据校正,特别是经验等效点的吸收校正,以考虑晶体形状对数据的影响。在使用SADABS时,用户需要准备原始数据文件(如*1.RAW)以及可能的其他辅助文件,比如校正结果文件(*.abs)和精修后的衍射点文件(*.hkl)。此外,软件还支持矩阵文件(*.p4p),包含了单胞参数信息。
XPREP负责数据预处理,用户需要输入预处理设置并生成预处理文件。XS用于结构解释,解析处理后的数据以推断分子结构。XP用于结构图形展示,帮助用户直观理解结构模型。XL则用于结构修正,对初步结构进行优化。最后,XCIF生成结构报告,将最终的结构信息以通用的CIF格式输出。
实验室环境中,Shelxtl 5通常会提供一些额外的文件类型,如帧文件(frame1.*、frame2.*)和SAINT文件,这些文件用于记录数据处理过程中的信息。此外,还有特定的FTP服务器地址和登录信息,以便于在局域网内访问和下载数据。
Shelxtl 5是一个集成的结构分析平台,涵盖了数据采集、校正、处理到最终结构解析和报告生成的整个流程,为研究人员提供了高效且精确的晶体结构研究工具。
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条之
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