草鱼Tβ11基因cDNA克隆与序列分析
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更新于2024-08-12
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"草鱼胸腺素β11的cDNA克隆及序列分析 (2012年),由辜文博、袁恬等人在四川大学学报(自然科学版)发表,研究通过cDNA末端快速扩增技术(RACE)获取了草鱼胸腺素β11的全长cDNA序列,NCBI登录号为HM120850,序列长度为320bp,包括47bp的5'非翻译区,141bp的3'非翻译区和一个132bp的开放读码框,编码43个氨基酸。"
草鱼胸腺素β11是鱼类体内一种重要的免疫调节肽,其cDNA序列的克隆和分析对于理解鱼类免疫系统的功能具有重要意义。在本研究中,研究人员以草鱼肠道cDNA文库中获取的β胸腺素EST序列为基础,采用RACE技术进行扩增,成功获得了草鱼胸腺素β11的完整cDNA序列。这个序列的分子生物学特征分析显示,5'非翻译区有47个碱基对,而3'非翻译区则有141个碱基对。编码的开放读码框(ORF)长度为132bp,能够翻译成一个包含43个氨基酸的多肽链。
蛋白质预测分析指出,这个草鱼胸腺素β11的等电点为5.17,分子量约为4892 Da。通过与其他脊椎动物的同源性比较,发现草鱼胸腺素β11与斑马鱼的同源性最高,达到了93.0%。这表明两者在进化过程中可能具有高度的保守性。结构预测结果显示,草鱼胸腺素β11的二级结构符合胸腺素家族的典型特征。
胸腺素是一类多肽,主要在胸腺中合成,参与免疫系统的发育和成熟。它们在多种生物体中发挥着重要作用,包括细胞增殖、凋亡调控以及免疫反应的激活。草鱼胸腺素β11的研究不仅有助于了解鱼类的免疫防御机制,也为鱼类养殖业提供了潜在的疾病防治策略。通过对胸腺素β11的深入研究,未来可能开发出针对鱼类疾病的新型治疗方法或疫苗,提高养殖效率和经济效益。
此外,这项工作还为其他非模式生物的基因克隆和功能分析提供了参考方法,特别是对于那些在传统实验模型中难以研究的物种。通过类似的cDNA克隆技术,可以揭示更多未知生物分子的功能和作用机制,促进生物学、免疫学和水产养殖领域的科学研究进步。
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