transcriptic公共协议:自动化实验室协议分享
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更新于2024-12-20
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资源摘要信息:"Transcriptic 是一个生物技术领域的自动化实验执行平台,它允许用户以编程的方式定义实验协议,并通过平台的机器人自动化进行实验操作。Transcriptic 的公共协议(public protocols)是指平台已经预先编写的实验步骤,这些步骤可以被任何人访问和使用,以执行特定的生物实验任务。
在提供的文件中,我们可以看到几个具体的Transcriptic公共协议的描述:
1. Spread N'Pick 协议:这个协议的主要目的是采集和培养细菌样品。具体操作包括采集最多六个细菌样品,将其接种到平板上,然后从每个平板中拾取八个菌落。之后,将这些菌落进一步培养在液体肉汤中。最终,为使用者提供一个96孔深孔板,用于培养这些菌落。这个过程涵盖了从平板培养到深孔板培养的典型实验室操作,适于细菌的生长、扩增和后续的研究应用。
2. Serial Dilute Plus 协议:此协议用于稀释样品并选择特定的介质进行实验。用户可以从试剂分配列表中选择介质,并指定稀释系数。当前平台支持的最大稀释度为8,这意味着样品可以按照1:8, 1:64, 1:512等比例进行稀释。此外,用户还可以选择将原始浓度的样品铺板,以便进行对比实验。这个协议特别适用于需要精确控制样品浓度的实验,比如最小抑制浓度(MIC)的测定或细胞计数实验。
3. 甘油储存协议:这个协议用于长期储存细菌菌种。具体步骤是将等分的样品与500µL的40%甘油混合,然后存储在-80°C的条件下。甘油作为一种防冻剂,能够保护微生物细胞在冷冻过程中避免细胞膜破裂和DNA损伤,从而保持微生物的活性,使其可以在需要的时候复苏和使用。这是一种常见的生物样本长期储存方法。
以上这些协议都与生物实验操作相关,涉及样本的采集、处理、培养和储存等基本实验技能,是微生物学、分子生物学和生物技术等领域的基础实验操作。
关于标签“Python”,虽然在这个描述中没有直接提及编程语言Python,但Transcriptic平台允许用户使用Python编程语言来定义和执行实验协议,这可能意味着这些公共协议在平台上可能是以Python脚本的形式实现的。Python因为其简洁和易读的特性,在生物信息学和实验室自动化领域得到了广泛的应用。
文件名称列表中的“transcriptic_public_protocols-master”表明这是一个包含Transcriptic公共协议的主文件夹,这可能是一个GitHub仓库的名称,用于存储和管理这些公共协议的代码版本,允许用户下载、查看和使用这些协议。"master"通常表示这是主分支,包含了最新的稳定代码。"
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2021-03-13 上传
2021-03-25 上传
2021-04-08 上传
2022-09-24 上传
2022-09-19 上传
2021-06-26 上传
谢平凡
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