第
38
卷第
8
期
2010
年
8
月
西北农林科技大学学报(自然科学版)
Jom
口
al
of Northwest
A
也
F
University(Nat. Sci.
Ed.)
Vo
1.
38
No.8
Aug. 2010
小麦过敏性诱导反应基因
TaHIR4
的
克隆及序列分析
张
岗孙燕飞李依民董艳玲夏
宁王晓杰黄丽丽康振生1,
2
(1西北农林科技大学植物保护学院,陕西杨凌
712100
,
2
陕西省农业分子生物学重点实验室,陕西杨凌
712100)
[摘 要]
【目的】克隆条锈菌诱导的小麦过敏性反应
(Hypersensitive
induced reaction,
HIR)
基因
Tα
HIR4
,
分
析其编码蛋白的结构、进化与功能。【方法】采用电子克隆、
RT-PCR
技术,从条锈菌侵染的小麦中,分离过敏性诱导
基因
Tα
HI
囚
R4
,
并对其进行克隆和序列分析;和利
j
用
In
且川
lt
优巳
rProS
汝
can
,
TMp
严
3
兀
r
巳时
d
、
S
耶
lalP
3.
0
队、
PSORT
等在线分析工具,预测
TaHIR4
蛋臼的保守结构域、跨膜结构、
f
信言号肤、细胞定位等特征;采用
DNASTAR
软
f
件牛分别进行氨基酸序列同源性
比对和进化树分析
O
【结果】分离到小麦过敏性诱导基因,命名为
Tα
HT
囚
R4(867
bp
,
G
巳
m
且
Ba 且此
k
注册号为
F
盯
J
川
02
囚
86
创
63盯)
,该
基因编码
1
条由
288
个氨基酸组成的多肤;
TaHIR4
蛋臼含
HIR
蛋臼家族的保守
SPFH(
伪
Stωoma
川汕
tins
,
P
扣
ro
咄
h
巾
i
让
tin
且
n
,
Flo
创
otiω
i
让
l
lins ,
HflK/C)
、
PHB(P
巳
ro
咄
hi
池
bi
让
tin
且
homologues)
结构域,有
4
种典型的
motifs(
蛋白激酶、醋蛋白激酶
H
、醋氨酸激酶磷酸
化和
N
豆寇酌化位点儿
N
末端的
19
个氨基酸序列内部存在跨膜信号肤结构,可能属于分泌蛋白;
TaHIR4
与
HvHIR4
蛋白的亲缘关系最近,同源性最高
(98%)
,其次为
OsHIR4
,同源性为
91%
。【结论】分离到
1
个条锈菌诱导
的小麦
HIR
基因
Tα
HIR4
,
其编码蛋白可能属于分泌蛋白,在胞外行使功能。
[关键词]
小麦;条锈菌;过敏性反应;电子克隆;结构域
[中图分类号]
S512.103
[文献标识码]
A
[文章编号]
1671-9387(2010)08-0111-08
Cloning
and sequence analyses
of
a hypersensitive induced
reaction gene
TI
α
HIR
4
in
wheat
ZHANG
Gang
1
,
SUN
Yan-fei
1
,
LI
Yi-min
1
,
DONG
Yan-ling
1
,
XIA
Ning
1
,
WANG
Xiao-jie
1
,
HUANG
Li-li
1
,
KANG
Zhen-sheng
1.
2
(1
College
ο
J
Plant
Pr
ο
tectz
ο
n
,
N
ογ
thwest
A&F
Uη
iversity
,
Yangling
,
Shaan
年口
712100
,
Chin
α
,2
Sha
αη
xi
Pr
ο
vincial
Key
Laborat
ογyο
J
Molecular
Biology
J
,
ογ
Agriculture
,
N
ογ
thwest
A&F
University
,
Ya
η
gli
ηg
,
Shaa
η
xi
712100
,
China)
Abstract:
<
Objective]
The
study
was
conducted
to
clone
TaHIR4
, a
wheat
hypersensitive
induced
reac
tion
gene
induced
by
stripe
rust
pathogen
infection
and
to
analyze
the
structure
,
evolution
and
function
of
the
encoded
protein.
<
Method
>
In
silico
cloning
and
RT-PCR
methods
were
taken
to
isolate
the
wheat
HIR
gene
in
Xingzi9104
infected
by
Puccinia
striiformis
f.
Sp.
tritici
(PST).
Charact
盯
istics
of
the
conserved
domain
,
transmembrane
structure
,
signal
peptide
,
and
localization
of
the
encoded
TaHIR4
protein
were
de
ter
口'lÎ
ned
using
bioinforr
丑
atlcs
an
日
lyses
including
InterProScan
,
TMpred
,
Sign
日
lP
3. 0 ,
and
PSORT
,
respec
tively.
The
analyses
of
multiple
alignment
and
phylogenetic
tree
were
performed
using
DNASTAR
software
package.
<
Result
>
The
wheat
HIR
gene
,
designated
as
TaHIR4
(867
bp)
,
was
isolated
,
and
deposited
in
关
[收市日期]
2010-01-26
[基金项目]
国家自然科学基金项目
(30930064
,
30800712)
,农业部现代农业产业技术体系建设专项资金项目;高等学校学科创新引
智计划项目(B
07049
川国家"十一五"支撑计划项目
(2006BAD08A05)
[作者简介]
张
岗(1
981-)
,男,陕西兴平人,博士,主要从事植物分子病理学和药用植物分子生物学研究。现在陕西中医学院、中
国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所工作。
E-mail:
J
ay
_gumling2003@yahoo.
∞
ffi.
cn
[通信作者]
康振生(1
957
人男,四川安岳人,教授,博士,主要从事病原物与寄主植物互作关系的细胞学和分子生物学研究。
E-mail:Ka 且
gzs
⑥且
wsua
f.
edu.
四