Matlab脚本实现二维三维t-SNE绘图指南

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资源摘要信息:"简单的 t-sne 绘图仪" 知识点: 1. t-SNE(t-Distributed Stochastic Neighbor Embedding)概念: t-SNE 是一种非线性降维技术,主要用于高维数据的可视化。它通过将高维空间中的数据点映射到低维空间(通常是二维或三维),同时尽可能保持原始数据点之间的相对距离。t-SNE 由 Laurens van der Maaten 和 Geoffrey Hinton 在 2008 年提出,并且在数据科学社区中广泛应用于数据可视化。 2. t-SNE 的工作原理: t-SNE 的核心思想是通过概率分布来表示高维数据点之间的相似性,并在低维空间中找到一个新的概率分布,使得两个空间的相似性尽可能接近。具体来说,t-SNE 有两个步骤: a) 高维空间的概率分布:通过计算任意两个点的高斯概率分布,为高维空间中的点对定义相似性。 b) 低维空间的概率分布:在低维空间中,通过尝试匹配高维空间中的概率分布,来找到新的点对相似性。 t-SNE 使用梯度下降等优化技术来最小化两个空间之间的差异。 3. Barnes-Hut 近似: 由于 t-SNE 的计算复杂度较高,特别是对于大规模数据集,直接计算所有点对的相似性是不切实际的。Barnes-Hut 近似是一种有效的近似算法,它利用四叉树或八叉树(取决于维度)来组织空间数据,从而减少需要直接计算的点对数量。这种方法使得 t-SNE 可以在相对合理的时间内处理成千上万的数据点。 4. Matlab 脚本使用说明: 本资源提供了一个用于 Matlab 的脚本,这个脚本可以绘制出 2 维或 3 维的 t-SNE 结果图。使用该脚本的步骤包括: a) 克隆(Clone)脚本所在的存储库(GitHub Repository)。 b) 准备数据和标签文件。数据文件应该包含两部分:第一列是标签名称,其余列是特征;标签文件的排列方式与数据文件中的标签顺序相对应。 c) 确保每一行对应一个样本,替换脚本中指定的输入目录,使用相同的文件名。 d) 运行脚本进行 t-SNE 绘图。 5. Matlab 开发环境: Matlab 是一个高性能的数值计算和可视化软件,广泛应用于工程计算、数据分析和图形设计等领域。Matlab 提供了丰富的函数库,用户可以通过编写脚本或函数来实现复杂的数学计算和图形绘制。 6. t-SNE 应用场景: t-SNE 适用于高维数据的可视化,帮助研究人员和工程师直观理解数据的结构和模式。由于其在保持局部结构方面的优越性,t-SNE 常常被用于机器学习、模式识别、生物信息学等领域,以辅助数据探索和分析。 7. 关于资源的下载和解压缩: 压缩包文件的文件名称列表中包含 "github_repo.zip",这意味着用户可以下载该 zip 文件,解压后获取到脚本文件夹。在使用该资源之前,用户需要确保解压软件已正确安装在计算机上,然后对 "github_repo.zip" 进行解压操作以获取完整的脚本文件。 通过理解以上知识点,用户可以更加深入地掌握 t-SNE 技术,并有效地利用 Matlab 脚本来绘制高维数据的可视化图像,进而辅助进行数据分析和决策。