高性能低成本rhPCR与通用报告器：SNP基因分型新方法

本文研究介绍了一种名为rhAmp:registered:SNP基因分型的创新技术，这是一种基于RNase H2依赖性PCR (rhPCR) 的高性能且具有成本效益的基因分型方法。rhPCR的关键在于其独特的双酶系统，即结合了3'端封闭的DNA-RNA杂交引物和热稳定热启动RNase H2。封闭引物的设计使得它们只有在与完全匹配的目标序列杂交后才会被激活，从而减少了非特异性引物二聚体的形成，提高了PCR反应的特异性。 该技术的优势在于其利用了重组PCR (rhPCR) 的特性，通过核糖的5'端切割引物，释放封闭基团，使引物能够顺利延伸，这有助于精确检测单核苷酸多态性 (SNP)。此外，研究者采用突变的Taq DNA聚合酶进一步提升了特异性，确保了等位基因的准确识别。使用通用报告系统，只需要针对每个双等位基因SNP设计一个报告探针，简化了实验流程，降低了成本。 研究人员验证了这一方法的有效性，选择了1000个随机SNP进行测试，结果显示设计成功率高达95%，并在130个人类SNP目标上进行了二次采样，获得了98%的呼叫率和99%的呼叫准确性。这种rhAmp SNP基因分型技术适用于多种qPCR仪器，包括QuantStudioTM 7 Flex、CFX384TM、IntelliQube:registered:和Biomark HDTM，具有广泛的平台兼容性。 这项研究发表于《生物科学与生物技术》(Advances in Bioscience and Biotechnology)，2018年9月，展示了在遗传分析领域的一项突破，不仅提高了SNP分析的效率，还降低了整体成本，对于基因组学研究和临床诊断具有重要的应用价值。通过集成DNA Technologies公司的Genetic Analysis R&D部门的研究，这一技术有望在未来推动个性化医疗和精准医疗的发展。