NTSYS软件聚类分析入门教程：Excel数据处理与操作指南

NTSYS中文使用说明 NTSYS是一款专用于聚类分析的软件工具，适用于处理诸如RFLP（限制性片段长度多态性）和RAPD（随机 amplified polymorphic DNA）等生物样品的电泳带型数据，以及微生物群落多样性的相似性分析。本指南将详细介绍如何在Windows环境下使用NTSYS-PC进行数据分析。 首先，准备工作是创建一个0-1矩阵，这是NTSYS的基础输入格式。在Excel中，第一行应定义矩阵规则，A1为带型存在标记为1，如B1表示RFLP有9个带型，C1则记录样本总数，D1用0表示无带。第二行通常用于填写样本名称。从第三行开始，A列列出带型名称，确保矩阵从B3行开始，因为第二行通常是空的，仅保留列标题。 启动NTSYS-PC后，首先在similarity界面导入或新建矩阵。通过点击Qualitative data选项，进入数据输入界面，选择inputfile导入之前保存的Excel文件。然后选择一个输出文件名（例如，111），点击compute运行计算，这将生成一个相似度表。 接下来，在clustering模块中，打开保存的文件111，选择一个新的输出文件名（比如222），并将Incaseof ties设置为Find，再次点击compute，完成聚类计算。这个步骤的结果将用于后续的图形分析。 图形化展示是通过Graphics菜单下的treeplot功能实现的。选择文件222作为输入，然后点击compute生成聚类树图。这个图表直观地展示了样品之间的关系和分类。 最后，通过以上步骤，用户已经掌握了NTSYS-PC的基本操作流程，包括设置Excel矩阵、导入数据、计算相似度、聚类分析和可视化结果。需要注意的是，每次操作后都要保存和关闭相关的文件，以保持工作流程的清晰和数据的安全。 总结来说，NTSYS中文使用说明涵盖了从数据预处理到聚类分析的关键步骤，包括数据组织、软件界面导航、计算执行和图形展示，这对于生物学研究者和数据分析人员来说，是一项高效且实用的工具。通过遵循这些指导，用户能够熟练掌握NTSYS并应用于实际的研究项目中。