BankIt向NCBI在线提交序列指南
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更新于2024-09-11
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"利用BankIt向NCBI在线提交序列"
向NCBI(美国国家生物技术信息中心)提交序列是生物学研究中常见的步骤,用于共享和存储科研数据。BankIt是NCBI提供的一种在线工具,允许研究人员方便快捷地提交DNA或RNA序列。这个过程不仅涉及到序列本身,还要求提供有关序列的详细背景信息,以便于科学界的交流和理解。
首先,你需要整理好序列的相关信息。这包括但不限于序列的来源地、寄主信息(如寄主物种、症状)、采集者信息,以及序列分析的结果,如序列全长、开放阅读框(ORF)的位置和长度、翻译出的氨基酸序列等。这些详细信息对于确保序列被正确分类、注释和理解至关重要。
接着,访问BankIt网站并进行登录。如果你还没有账户,需要注册一个新的账号,注意这个账号与NCBI的通用账号不同。注册时需要填写的个人信息包括职位、名字、姓氏、登录名、所属机构地址以及电子邮件地址。完成注册后,你会收到一封包含随机密码的邮件,使用这个密码登录,并在登录后可自行更改密码。
登录BankIt后,系统会自动分配一个Submission ID,但这并不是最终的序列ID。接下来,你需要按照九个步骤完成序列提交:
1. **Contact Information**:填写联系人信息,包括姓名、机构和电子邮件,确保信息无误,以便后续的沟通。
2. **Reference**:在此填写参考作者信息和序列的出版状态。如果你的序列尚未发表,选择“Unpublished”,如果有相关文章,需提供文章的详细信息。
3. **Project/Investigation**:描述你的研究项目或调查内容,提供研究的背景和目的。
4. **Sample**:录入样本信息,如样本编号、采集日期、采集地点等。
5. **Experiment**:描述实验设计和方法,包括所使用的测序技术等。
6. **Organism**:指定序列来源于哪个物种,必要时可以提供更具体的分类信息。
7. **Sequence Data**:上传你的DNA或RNA序列数据,可以是FASTA格式或其他支持的格式。
8. **Features**:标注序列上的特征,如ORFs、启动子、终止子等。
9. **Summary and Submit**:最后,检查所有填写的信息,确认无误后提交你的序列。
提交完成后,NCBI会进行审核,审核通过后,你将获得一个正式的GenBank登录号,这个号码将成为你的序列在数据库中的唯一标识。这个过程可能需要一些时间,期间你可以通过登录账户查看提交状态。
BankIt简化了序列提交流程,使得非专业计算机用户也能轻松完成提交,促进了科研数据的公开和共享。对于生物学研究者来说,掌握BankIt的使用方法是十分必要的。
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2022-06-12 上传
2024-11-05 上传
2024-11-06 上传
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