wincoot基础入门:模型搭建与操作指南
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更新于2024-09-08
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Wincoot简易教程是一份针对晶体学模型搭建软件Wincoot的详细指南,它旨在帮助用户理解和掌握这款在该领域广泛应用的工具。本教程分为几个主要部分,涵盖了从基本操作到高级功能的全面介绍。
首先,章节"1 Mousing"介绍了鼠标操作技巧,包括如何通过左键拖动旋转视图、使用Ctrl+左键进行平移、Shift+左键用于标记原子、右键拖动实现缩放和使用中键或滚轮调整地图轮廓级别。这些基础操作是Wincoot界面交互的基础。
接着,"2 Introductory Tutorial"开始深入教学。这部分从获取所需的文件开始,然后指导用户如何启动Coot(可能是指通过CCP4 Workshop Bangalore提供的资源)。后续内容依次教授如何显示坐标、调整虚拟跟踪球、查看和控制地图显示、以及放大缩小和聚焦于不同的原子。
在"3 Model Building"部分,重点转向了模型构建。讲解了如何使用旋转器选择合适的rotamer(构象)、进行更深入的实空间精炼,这些都是模型建构过程中的关键步骤。
"4 Blobology"涉及的是Blob分析,即寻找和识别结构中的关键区域或团块。教程提供了对Blob3和Blob2两种方法的详细介绍,并教导如何制作出美观的图片展示结果。
"5 Extra Fun (如果你有时间)"则是一些额外但有趣的特性,例如处理水分子、添加终端残基、改变残基状态,以及显示对称性原子。这部分展示了Wincoot的灵活性和定制化选项。
最后,"5.5 Refmac Refinewith"提到使用Refmac进行后期的结构优化,确保模型的准确性和可靠性。
这个Wincoot简易教程为新用户提供了清晰的入门路径,同时也为有一定经验的用户提供实用的进阶技巧,有助于提升在晶体学建模工作中的效率和精度。通过学习和实践,用户可以熟练掌握这款重要的软件工具。
2021-06-29 上传
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一飞秒觉悟
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