埃及大麦基因型耐盐性分析：Triple-SCoT与SSR标记的新策略

该研究探讨了三重SCoT（Specific Amplification of Contiguous Loci Through Primers，特定连续位点通过引物放大）技术在评估埃及大麦基因型遗传多样性和鉴定基因型特异性标记方面的效率，与传统的SSR（Simple Sequence Repeats，简单序列重复）标记系统进行了比较。实验涉及10个埃及大麦基因型，包括2个商业品种和8个育种系，分别在正常和盐分胁迫条件下种植，以筛选出耐盐基因型。 在盐分胁迫条件下，使用磁化率指数（Susceptibility Index，SI）来量化植物对盐分的敏感程度，通过比较无压力下的产量潜力与压力环境下的变化。根据耐受性指数，吉萨123、1号线、5号线、6号线和8号线被确定为耐盐基因型。 为了揭示基因型间的遗传变异，研究人员使用了7个SSR标记和3个SCoT引物的不同组合。正常的SCoT反应可以扩增出15到19个不同长度的DNA片段。研究中提出的新策略是通过在每个反应中使用两种或三种不同的引物，以提升SCoT技术在遗传多样性研究中的潜力。 结果显示，Triple-SCoT和SSR的多态性百分比分别为94.44%和90.91%，表明Triple-SCoT在检测遗传变异方面具有更高的效率。在两个标记系统中，每种引物产生的多态性片段平均数分别为17和7.14，表明Triple-SCoT也更倾向于产生更多的多态性标记。此外，Triple-SCoT在识别基因型特异性标记方面表现突出，阳性与阴性标记的平均数量高于SSR系统。 为了进一步分析基因型，研究人员利用这些标记系统进行了聚类分析，生成了四个树状图的拓扑结构，这些图揭示了基因型之间的关系和遗传相似性。这些结果强调了Triple-SCoT在遗传多样性和基因型鉴定中的优势，可能有助于未来的大麦育种计划，尤其是在面对盐分胁迫的环境下。 这项工作发表在《美国分子生物学杂志》（American Journal of Molecular Biology）2017年第7期，作者是Aziza A. Aboulila和Mohamed Mansour，他们分别来自开罗大学的遗传学系和埃及农业研究中心的谷物作物研究所大麦部。文章的DOI为10.4236/ajmb.2017.73010，对理解和利用大麦基因型的遗传差异以应对环境压力提供了宝贵的科学依据。