Matlab集成C代码实现MP2RAGE数据的T1map和R1map计算

资源摘要信息:"matlab集成c代码-app-mp2rage-computeT1andR1:提供降噪的mp2rage图像时，计算T1map和R1map图" 1. MATLAB集成的C代码应用 MATLAB是一种高性能的数值计算环境和第四代编程语言。它广泛应用于工程计算、数据分析、图像处理和算法开发等领域。在本资源中，涉及到的是MATLAB与C语言代码的集成应用。C语言具有较高的执行效率和较强的硬件控制能力，因此在需要性能优化的场景中，将C代码嵌入到MATLAB环境中可以提高程序的运行速度和效率。集成C代码通常通过MATLAB的MEX函数实现，MEX函数允许开发者将C或C++代码编译成动态链接库（DLL），然后在MATLAB中直接调用这些函数。 2. 应用程序功能 app-mp2rage-computeT1andR1是一个特定的应用程序，用于处理MP2RAGE（Magnetization Prepared 2 Rapid Acquisition Gradient Echoes）序列的医学图像数据。该程序的目的是估算T1加权图像（T1map）和R1映射图（R1map）。T1加权图像是一种MRI图像，其亮度与组织的T1弛豫时间（即纵向磁化矢量恢复到平衡状态的时间常数）成正比。R1是指单位时间内T1弛豫过程的减少量，R1map则是将不同组织的R1值映射为图像。这些信息对于医学成像分析非常重要，可以用于诊断和研究。 3. 应用程序的使用前提 在使用app-mp2rage-computeT1andR1计算T1和R2地图之前，用户需要对mp2rage图像进行降噪处理。因此，需要先使用app-mp2rage-denoiseUNI应用程序来对图像进行降噪。这一步骤是必要的，因为降噪可以去除图像中的噪声，提高最终计算结果的准确性。 4. 硬件和数据源的特定要求 当前版本的app-mp2rage-computeT1andR1仅支持西门子MRI扫描器上收集的MP2RAGE数据。这意味着对于使用其他品牌MRI扫描器的用户来说，他们可能需要对程序进行额外的调整，或者需要开发新的版本来兼容不同厂商的数据格式。 5. 作者和项目信息 索菲亚（Sophia Vinci-Booher）是该应用程序的作者。她对代码进行了修改，以适应Brainlife.io平台的需求。Brainlife.io是一个开放科学平台，专注于实现大脑数据的共享、分析和存储。除了应用程序的作者之外，项目还得到了其他研究人员的支持和指导，如项目总监佛朗哥·佩斯蒂利（Franco Pestilli）。 6. 引用和资金信息 用户在使用本代码进行研究和发表论文时，需要引用相关的文章以确保学术诚信。资源中提到的引用包括在brainlife.io平台上的相关文献，以及关于MP2RAGE序列的特定文献。这既是对原始研究工作的尊重，也是为了保证科学结果的可追溯性。 7. 系统开源标签 "系统开源"标签表明app-mp2rage-computeT1andR1应用程序是开源的。开源意味着该软件的源代码可以被任何人查看、修改和分发。这样的开放性能够鼓励社区的协作，促进代码质量的提升，并加速科学和技术的进步。 8. 文件名称列表 提供的压缩包文件名称为app-mp2rage-computeT1andR1-main。这表明用户可以通过这个文件来访问和部署应用程序。文件名中的“main”可能指的是包含主程序或主函数的文件，这是运行应用程序所必需的。