梅花SSR引物开发：近缘物种与EST-SSR的应用

"这篇论文是2011年由北京林业大学的研究团队发表的，主要探讨了梅花（Mei flower）微卫星序列（SSR）引物的开发，利用梅花近缘物种的SSR引物和梅花EST（Expressed Sequence Tags）数据库中的EST-SSR序列。研究目的是为了获取更多的梅花SSR标记，以促进梅花遗传多样性的研究和育种工作。" 文章中提到，研究人员首先筛选了84对梅花近缘物种的SSR引物，并设计了23对基于梅花EST序列的EST-SSR引物。在12个不同梅花品种上进行实验，结果显示近缘物种的引物中有69对能够成功扩增出DNA条带，有效扩增率达到82.1%。这表明大部分引物在梅花中具有良好的适用性。 通过对这些扩增出的条带进行分析，研究人员发现14对引物产生了85个等位基因，平均每个引物产生6个等位基因。等位基因的有效数量在2.072到5.539之间，平均值为4，这反映了梅花基因组的多样性。多态信息含量（PIC）是衡量遗传多样性的重要指标，研究中的PIC值范围在0.483到0.786之间，平均值为0.695，这表明所选引物具有较高的遗传多态性。 Shannon指数用于衡量遗传多样性，平均值为1.528，进一步证实了梅花种群的遗传复杂性。通过计算12个品种间的遗传相似系数，发现它们之间的遗传差异显著，系数范围在0.13到0.60，平均值为0.26。其中，'玉蝶龙游'梅与'小玉蝶'梅的相似系数最高，为0.60，而'美人'梅与'黄金'梅的相似系数最低，只有0.13。 此外，设计的23对EST-SSR引物中有22对成功扩增，有效扩增率达到95.6%，其中11对显示出了多态性，占所有EST-SSR引物的47.8%。这表明基于EST的引物设计在提高多态性检测效率方面具有优势。 该研究成功开发了一系列适用于梅花的SSR引物，这些引物对于理解梅花的遗传结构、进行遗传多样性分析以及梅花品种鉴定和改良工作具有重要意义。同时，该研究也为其他植物的SSR引物开发提供了参考方法。