SPM8:功能图像文件f开头预处理与数据分析步骤详解
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更新于2024-08-20
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本资源介绍了SPM8(Statistical Parametric Mapping)在处理功能图像文件时的详细步骤,特别是针对f开头的经过转换的文件。首先,我们了解到数据源来自于SIEMENS 3.0T MR设备的全脑解剖像(t1_mpr_ns_sag_p2_iso)和功能像扫描(ep2d_bold_moco),并使用经典的棋盘格视觉刺激作为实验设计。
SPM5软件环境依赖于MATLAB,因此在使用前需确保MATLAB已安装,并将SPM安装到C盘根目录下。环境设置包括指定数据目录,避免中文路径导致的编码问题,以及设置SPM路径。数据导入是核心步骤,通过SPM工具导入DICOM图像,选择合适的文件夹保存输出文件,且可能需要对Philips数据进行额外的转换(如使用mricron工具的dcm2nii)。
数据预处理是关键环节,主要包括:
1. **Realign** (头动校正):由于在扫描过程中,被试可能会有头部移动,头动校正技术可以减少这些运动带来的干扰,通过实时或静态的头位校准,使所有时间点的数据尽可能准确地对齐。
2. **Slicetiming** (时间点校正):考虑到不同层面的扫描时间可能存在差异,这个步骤用于同步同一事件的信号,确保时间轴的一致性。
3. **Coregister** (配准):将功能图像与解剖图像进行空间配准,确保功能数据与解剖结构的对应关系。
4. **Normalise** (标准化):将数据转化为标准空间模板,如MNI空间,便于跨被试间的比较。
5. **Smooth** (平滑):降低数据中的噪声,通常使用高斯滤波器,根据研究需求调整不同的平滑程度。
在数据导入后,用户可以使用"Display"功能查看转换后的图像,并在此过程中定义原点(前联合和AC-PC连线),这对后续的正常化步骤至关重要。完成这些预处理步骤后,数据便为后续的统计分析做好了准备。在整个流程中,SPM8以其强大的功能和严谨的统计方法,为神经影像学研究提供了有力的支持。
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