苯甲酮类与噻唑啉苯磺酸类HIV-1逆转录酶抑制剂的分子对接与QSAR研究

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"苯甲酮类及噻唑啉苯磺酸类HIV-1逆转录酶抑制剂的分子对接和定量构效关系研究" 本文详细探讨了两类HIV-1逆转录酶抑制剂——苯甲酮类和噻唑啉苯磺酸类化合物的分子对接和定量构效关系(QSAR)。研究人员闫宁和梅虎通过对32种含苯甲酮(BP)骨架和21种含噻唑啉苯磺酸(TBS)骨架的抑制剂进行分子对接分析,旨在理解这些化合物与HIV-1逆转录酶的相互作用机制,并构建预测活性的QSAR模型。 在分子对接研究中,研究人员发现苯甲酮类抑制剂在HBY结合位点的对接位置与已知晶体结构的RMSD值仅为0.653Å,远小于1Å,这表明对接结果的可靠性。对接结果强调了氢键和疏水作用在这些抑制剂与K103N突变受体相互作用中的关键角色。化合物的对接得分与实验活性之间存在显著正相关性,相关系数r为0.7576,且P值小于0.0001,这进一步验证了对接方法的有效性。 为了深入理解构效关系,作者执行了多种QSAR方法,包括基于对接结果的HQSA