R Summit分享：R Markdown与GitHub在工作流程中的应用

资源摘要信息:"2015-06-28_r-summit-talk:在R Summit和Workshop上谈论在工作流程中使用R Markdown和GitHub" 在本次R Summit和Workshop中，演讲者分享了他们在使用R Markdown和GitHub进行工作流程管理方面的经验和见解。以下是演讲的主要内容和知识点： 1. R Markdown的使用 R Markdown是一个能够将数据分析与报告撰写合二为一的强大工具，支持多种输出格式，如PDF、HTML、Word文档等。它允许用户将R代码与文本混合，生成结构化的文档。对于研究生课程中的教学和高级用户在开发中的应用，R Markdown提供了一个简洁、高效的方式来整合数据分析和文档撰写。 2. GitHub的整合 GitHub是一个代码托管平台，广泛用于版本控制和协作。演讲者强调了将.Rmd和.R文件放置于GitHub上的重要性。这样做可以提高代码的可见性和可访问性，同时鼓励他人查看和运行你的代码。 3. 文件的呈现与共享 演讲者提倡将.Rmd和.R文件呈现为Markdown或HTML格式，并将它们放在公共领域，例如GitHub，以便其他人可以访问和理解。这种开放共享的实践有助于同行评审和代码复用，同时也是评估代码质量的一种方式。 4. GitHub作为项目网页 通过利用GitHub上的Markdown和其他浏览功能，源代码仓库可以兼任一个优质的项目网站。这可以为项目提供一个展示和交互的平台，同时促进项目团队与外界的沟通和合作。 5. 代码提交策略 演讲者建议开发者制定不提交中间产品或最终产品的政策。这意味着只将源代码提交到版本控制系统，而将那些构建或中间文件留在本地，从而保持仓库的整洁性。 6. GitHub搜索的高级用法 为了提高开发效率，演讲者提到利用GitHub的高级搜索功能，结合Winston Chang和Gábor Csárdi开发的相关工具，可以快速找到相关代码的引用和使用实例。 7. 成功工作流程的构建 演讲者最后强调了构建一个成功的R Markdown与GitHub工作流程的重要性。通过整合这些工具和实践，R语言用户可以更加高效地进行数据分析、开发和协作。 这份演讲资源为R语言的用户提供了如何将R Markdown和GitHub用于工作流程管理的实用建议，同时也展示了如何通过这些工具进行有效的代码管理、协作和知识共享。它对于提高数据科学项目的组织性和透明度，以及提升研究和开发效率，具有重要价值。