"大分子结构数据库概览:PDB、MMDB、SCOP、DSSP"

1 下载量 154 浏览量 更新于2023-12-28 收藏 25MB PPTX 举报
蛋白结构数据库是由Brookhaven实验室于1971年建立的大分子结构数据库PDB,全称蛋白质晶体结构资料数据库(Protein Data Bank)。该数据库的维护由结构生物信息学研究合作组织(Research Collaboration for Structural Bioinformatics, RCSB)负责。数据来源主要包括通过实验(如X射线晶体衍射、核磁共振、电子显微镜方法等)测定的生物大分子的三维结构,主要是蛋白质的三维结构,还包括核酸、糖类、蛋白质与核酸复合物的三维结构。截止到年4月,PDB数据库已含有50277个结构数据,其中约93%是蛋白质的结构。 PDB数据库的建立旨在为科学家们提供一个开放、易于访问的平台,以便他们能够获取和分享有关生物分子结构的信息。在PDB数据库中,科学家们可以查找到关于不同生物大分子三维结构的详细信息,这些信息是通过各种实验手段进行测定的,包括X射线晶体衍射、核磁共振和电子显微镜方法等。PDB数据库还包括来自不同领域的研究数据,如蛋白质、核酸、糖类以及它们之间的复合物的三维结构数据,这使得科学家们可以在同一平台上获取到多种生物分子结构的数据。 除了PDB数据库外,还有其他几个重要的蛋白结构数据库,包括MMDB数据库、SCOP数据库和DSSP数据库。MMDB数据库是由美国国立生物技术信息中心(NCBI)建立和维护的,它收集了大量的生物分子三维结构数据,包括蛋白质、核酸和多肽等。SCOP数据库则是一种分类数据库,旨在将蛋白质的结构分为不同的层次,并为科学家们提供了一种更方便地查找和比较蛋白质结构的方式。另外,DSSP数据库则提供了有关蛋白质二级结构和二级结构中残基相互作用的数据。 总的来说,蛋白结构数据库的建立和发展为科学家们提供了一个重要的资源,使得他们能够更加方便地获取和分享关于生物分子结构的信息。这些数据库中包含了大量通过实验手段测定的生物大分子的三维结构数据,不仅有助于科学家们对生命科学的研究,还为药物设计和生物工程等领域的发展提供了重要的支持。通过这些数据库,科学家们可以更加深入地了解生物分子结构及其功能,从而为解决一系列人类健康和生活中的问题提供更有力的支持。