药物研究中的蛋白质组学：技术与标准化

"Proteomics in Drug Research" 是一本关于药物研究中蛋白质组学应用的专业书籍，由M. Hamacher、K. Marcus、K. Stühler、A. van Hall、B. Warscheid和H. E. Meyer编辑。本书涵盖了蛋白质组学在药物开发中的行政优化、数据标准化、技术应用等多个方面。 1. **行政优化蛋白质组学网络**：André van Hall和Michael Hamacher探讨了在药物开发中行政管理如何优化蛋白质组学网络。他们强调了管理的任务和目标，包括网络构建、生物标志物评估和建立蛋白质组学在药物开发中的网络。书中提到了国家基因研究网络的人类大脑蛋白质组项目和人类蛋白质组组织的大脑蛋白质组项目，这两个项目展示了行政网络化的实现过程。 2. **蛋白质组学数据标准化、沉积和交换**：Sandra Orchard、Henning Hermjakob、Manuela Pruess和Rolf Apweiler讨论了数据标准化的重要性，介绍了如UniProt、InterPro、Proteome Analysis、International Protein Index (IPI)和Reactome等蛋白质分析工具，以及数据存储、检索和Proteome Standards Initiative（PSI）的相关内容，这些标准对于数据交换和共享至关重要。 3. **差异凝胶电泳(DIGE)**：Barbara Sitek等人详细介绍了差异凝胶电泳（DIGE）这一技术，它是二维凝胶电泳的下一代技术，特别适用于临床研究。他们阐述了CyDye DIGE荧光染料的两种标记方法（最小标记和饱和标记），并提供了统计分析方面的考虑，包括数据校准、标准化、差异表达蛋白的检测、样本量确定和进一步的应用。 4. **生物质谱**：Bettina Warscheid讲解了生物质谱的基本原理和药物发现相关的方法，如激光解析离子化（MALDI）、电喷雾离子化（ESI），以及定量质谱技术，如代谢标记法，包括N标记、稳定同位素标记氨基酸在细胞培养中的应用（SILAC）和化学标记法。 5. **多维柱液相色谱(LC)**：Egidijus Machtejevas等人探讨了多维液相色谱（MD-LC）在蛋白质组学中的应用现状，解释了为何需要MD-LC/MS方法，并讨论了方法开发的基本方面，包括样品预处理、相系统选择和操作要点。 这本书通过深入的章节划分，详细展示了蛋白质组学在药物研发中的关键技术和方法，对于理解蛋白质组数据的管理、分析技术及其在新药开发中的应用具有重要价值。