3D寡核苷酸微阵列芯片技术检测2型糖尿病相关SNPs
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更新于2024-08-12
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"这篇论文是关于利用三维(3D)寡核苷酸微阵列芯片技术检测与2型糖尿病相关的单核苷酸多态性(SNPs)的研究。研究人员设计并构建了一种基于G4聚(酰胺-胺)PAMAM树枝状大分子修饰的载玻片的3D寡核苷酸微阵列芯片,用于筛选特定的寡核苷酸探针。他们以荧光化合物Cy5修饰的寡核苷酸作为检测探针,通过筛选16种(8对)寡核苷酸文库,成功找到一对可用于2型糖尿病检测的探针。实验以2型糖尿病易感基因TCF7L2的rs7903146位点为研究目标,证明了所选探针对靶标寡核苷酸具有高度特异性,能准确检测低至2%的等位基因频率。该研究受到国家自然科学基金的资助,主要作者专注于糖尿病分子发病机理的研究。"
本文详细阐述了如何运用微阵列芯片技术来识别与2型糖尿病关联的遗传标记,特别是单核苷酸多态性。2型糖尿病是一种复杂的多基因遗传疾病,其发病与遗传和环境因素密切相关。随着生活方式和饮食结构的变化,该疾病的发病率逐年攀升,对个人和社会健康造成了重大负担。尽管已知有少数由单基因突变引起的糖尿病类型,但大多数2型糖尿病是由多个基因变异的累积效应造成的,其具体遗传机制尚未完全揭示。
在本研究中,科研人员采用的是第四代PAMAM树枝状大分子修饰的载玻片,这种材料可以作为构建3D寡核苷酸微阵列芯片的基础。芯片上的固定探针由氨基修饰的寡核苷酸构成,而检测探针则是Cy5标记的寡核苷酸,两者结合产生荧光信号,从而实现对特定SNP的检测。通过筛选,他们锁定了与2型糖尿病相关的TCF7L2基因的rs7903146位点,该位点的SNP被认为与糖尿病风险增加有关。
实验结果显示,所设计的寡核苷酸探针能够特异性地识别目标SNP,并且具有很高的灵敏度,即使在等位基因频率非常低的情况下(如2%),也能准确检测出来。这一发现对于早期筛查、诊断和预防2型糖尿病具有潜在价值,因为识别这些遗传标记有助于更好地理解糖尿病的遗传基础,从而为个体化治疗和预防策略提供依据。
这项工作展示了微阵列芯片技术在基因组学研究中的应用,特别是在复杂遗传疾病如2型糖尿病的遗传因素分析方面。通过这种高通量的方法,科学家们可以更有效地探索和验证与疾病相关的遗传变异,进一步推动糖尿病的病因学研究和临床实践。
2021-07-26 上传
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2021-02-23 上传
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