CCLE数据库:癌症细胞系研究的宝贵资源
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更新于2024-06-20
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"CCLE数据库是一个综合性的癌症细胞系研究平台,全称为癌症细胞系百科全书,由美国多个著名研究机构合作建立。这个数据库包含了大量的人类癌细胞系的遗传信息,如DNA突变、基因表达、染色体拷贝数等,并且定期更新,新增了更多的遗传突变、RNA剪接、DNA甲基化、组蛋白修饰、microRNA表达和蛋白质表达等多组学数据。CCLE与TCGA等其他数据库互补,对于癌症机制的研究和精准医疗的推进具有重要意义。
CCLE数据库特色功能多样,其中包括:
1. 基因表达数据可视化:用户可以以条形图或散点图形式查看基因表达,同时与其他数据进行比较。
2. 多种数据获取方式:包括拷贝数分析、mRNA表达(基于芯片检测的Afy)、反相蛋白阵列(RPPA)用于蛋白质表达分析、限制性内切酶-重亚硫酸盐靶向测序(RRBS)用于DNA甲基化研究,以及mRNA表达(基于RNA测序)。
3. 基因甲基化分析:通过气泡图展示不同细胞系间的甲基化差异。
4. 突变数据查看和下载:用户可以在线查看单个细胞系的突变信息,并进行数据下载。
5. 图形制作工具:支持简易制作各种类型的科研图表。
6. 平台研究支持:提供了一个系统性的研究癌细胞系的平台,有助于抗癌药物的研发。
利用CCLE数据库,研究者可以深入研究基因在不同细胞系中的表达情况、突变状态、拷贝数变异以及甲基化模式,从而揭示癌症的复杂遗传特征。这个资源对于生物医学领域的研究者来说,是一个极其宝贵的工具,促进了癌症基因组学和精准医疗的进步。访问CCLE数据库的网址为http://[未提供完整网址]。"
2023-10-08 上传
2021-05-29 上传
2024-11-05 上传
2024-11-05 上传
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2023-04-03 上传
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2021-07-14 上传
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