VASP初学者教程:从Linux命令到实战计算
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更新于2024-07-24
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"这篇资源是关于VASP使用的基础教程,主要面向初学者,涵盖了Linux命令、SSH软件使用以及VASP的输入文件详解,并通过实例演示了如何进行计算。"
在量子化学计算领域,VASP(Vienna Ab initio Simulation Package)是一款广泛应用的软件,它基于密度泛函理论(DFT)进行第一性原理分子动力学模拟。本教程旨在帮助初学者理解和掌握VASP的基本操作。
首先,教程介绍了Linux命令的使用,这是操作VASP的基础。包括浏览目录(如使用`cd`、`ls`)、查看文件(`cat`及`more`)、创建与删除目录(`mkdir`、`rmdir`)、文件管理(`rm`、`vi`、`cp`、`mv`)以及获取系统信息(`df`、`du`、`top`、`psax`和`kill`)。熟悉这些基本命令能够有效提高用户在Linux环境中的工作效率。
其次,教程讲解了SSH软件的使用,特别是SSHtransfer,这用于在本地计算机与远程服务器之间传输文件,对于进行VASP计算至关重要。用户将学习如何进行文件传输和简单的应用操作。
接着,重点讲述了VASP的四个核心输入文件:
1. INCAR:包含计算的控制参数,如计算类型、交换关联泛函、自洽循环精度等。
2. KPOINTS:定义 Brillouin 区的采样点,用于布里渊区的网格设置。
3. POSCAR:描述晶体结构,包括原子种类、坐标、缩放因子等信息。
4. POTCAR:包含赝势文件,定义原子的电子结构近似。
最后,教程通过实例演示了如何使用VASP进行计算。从模型构建、参数测试,到晶胞优化(如铜单晶Cu的优化),再到不同分子(如CO、H、CHO)在Cu(100)表面的吸附和结构优化,甚至包括过渡态计算。这些实例帮助学习者理解并应用所学知识。
这份“VASP经验制作”教程是入门VASP计算的宝贵资料,通过实际操作和详细解释,使得初学者能够逐步掌握VASP的使用方法。
2021-07-06 上传
2024-10-24 上传
2024-10-24 上传
2024-10-24 上传
2024-10-24 上传
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