XenaR:便捷的R语言客户端连接UCSC Xena数据库

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资源摘要信息:"XenaR:简单的 R 客户端到 UCSC Xena 数据中心" 标题中的知识点说明: "XenaR" 指的是一个R语言编写的客户端软件包,它的目的是为了与“UCSC Xena”这一特定的基因组数据和分析中心进行交互。这个客户端的编写是为了简化用户与UCSC Xena平台之间的数据交互过程,使其变得更加直接和便捷。UCSC Xena(加利福尼亚大学圣克鲁兹分校Xena基因组数据和分析中心)是一个为研究人员提供丰富基因组数据集及相关分析工具的平台。通过使用XenaR,研究人员可以更加高效地访问和分析这些数据集。 描述中的知识点说明: 描述部分提供了关于XenaR软件包的详细信息。首先提到的是这个软件包是用R语言编写的,并且是通过从"inst/README.Rmd"文件生成的说明文档。文档中的“-- File”指的是该文件的存储路径,表明了软件包的来源以及它在文件系统中的位置。接下来的“-- Fields read: Title, Author, Version”说明了在生成文档时读取了哪些字段,包括软件包的标题、作者以及版本号。这有助于用户了解软件包的基本信息。 描述中还提到了输出部分,这里的“小插图”可能是指在生成的文档中所包含的图表或图形元素,这有助于解释或展示软件包的使用方法或数据分析结果。 标签中的知识点说明: 标签仅包含一个单词“R”,这表明该软件包是专门为R语言设计的,它依赖于R的编程和运行环境。标签是搜索和分类软件包时使用的关键字,因此,通过标签“R”,用户可以快速地找到适用于R语言环境的工具和资源。 压缩包子文件的文件名称列表中的知识点说明: 文件名称列表包含了"XenaR-master"。这个名称通常意味着该项目的代码库在版本控制系统(如Git)中的主分支。在这里,“master”表明这是软件包的主版本或主分支,意味着通常是最稳定、最完善的版本。这个名称可以帮助用户识别软件包的源代码或其发布的版本,通常在下载或安装软件包时会参考这个文件名。考虑到这只是一个文件列表,实际上我们无法从中获取更多的详细信息,除非能够访问文件的内容本身。 总结而言,通过上述文件提供的信息,我们可以了解到XenaR是一个专门为R语言编写的客户端软件包,它与UCSC Xena基因组数据和分析中心的数据平台对接,方便用户访问和分析数据。同时,它还有文档生成机制,并且可以追溯到特定的文件路径和版本信息。作为R语言的用户,这个软件包可以极大地提升基因组数据处理和分析的效率。