fgwas: 整合功能基因组学信息于全基因组关联研究工具介绍

资源摘要信息:"fgwas:功能基因组学和全基因组关联研究" 知识点: 1. fgwas定义: fgwas是一种命令行工具，主要用于将功能基因组信息整合到全基因组关联研究（GWAS）中。这种工具的出现，解决了基因组特定区域类型（如编码外显子，DNAse超敏位点等）在基因组关联研究中的应用问题。 2. GWAS概述: 全基因组关联研究（GWAS）是一种研究人类疾病和特定性状相关基因的方法。在这种研究中，科学家们会寻找与特定疾病或性状有关的基因位点。 3. fgwas应用场景: fgwas主要用于分析已经完成的GWAS或者GWAS的荟萃分析结果，尤其是当确定了数十个影响疾病或性状的基因座时，fgwas的使用效果最佳。如果至少有20个独立的p-位点，且p值小于5e-8，就可以使用fgwas进行进一步的分析。 4. fgwas功能: fgwas的主要功能是解决两个问题。一是这些关联是否在基因组的特定区域类型中得到了丰富，二是是否可以使用这些扩增来鉴定影响该性状的新基因座。 5. fgwas使用前提: 在使用fgwas进行分析之前，需要有一个已经完成的GWAS研究结果，且至少有20个独立的p-位点，p值小于5e-8。 6. fgwas基本模型: fgwas的基本模型在Pickrell JK（2014）的文章中进行了描述，这篇文章可以在bioRxiv上找到，文章的链接是10.1101/000752。 7. fgwas安装: fgwas的最新版本是0.3.6。在使用fgwas之前，需要先下载fgwas-0.3.3.tar.gz压缩包，然后进行解压和安装。 8. fgwas依赖: fgwas的运行依赖于一些其他的软件或者工具，这些依赖项的详细信息并未在描述中提供，可能需要用户自行查找。 9. fgwas标签: fgwas的标签是C++，这可能意味着fgwas是使用C++语言编写的，或者需要在C++环境中运行。 10. fgwas压缩包: fgwas的压缩包文件名为fgwas-master，用户需要下载这个压缩包，然后进行解压和安装，才能使用fgwas工具。 以上就是从给定文件的【标题】、【描述】、【标签】、【压缩包子文件的文件名称列表】中生成的相关知识点。