全基因组SSR标记揭示92份棉花资源的遗传多样性与复杂起源

本研究探讨了利用分布于全基因组的Simple Sequence Repeat (SSR) 标记来评价92份棉花资源的遗传多样性。 SSR标记因其在基因组水平上的均匀分布，使得它们成为评估生物群体遗传结构的理想工具。研究者选择了132个均匀覆盖棉花全基因组的SSR标记，对92个精选的棉花品种进行分型，共检测到494个多态性条带，平均每个多态性标记产生3.69个等位基因。多态性信息含量（PIC）范围从0.01到0.8714，平均值为0.5466，显示了显著的遗传变异。 通过计算品种间的相似系数，该自然群体中92个品种的平均成对相似系数为0.7292±0.1350，变异范围广泛，表明群体内部存在高度的遗传多样性。值得注意的是，在陆地棉种内，有48.94%的品种对相似系数低于0.800，而在海岛棉种内，这个比例为50.91%，这暗示着两个群体内部的遗传差异较大。 研究结果通过Jaccard's相似系数聚类和系谱分析揭示，棉花种质资源的遗传多样性来源于复杂的育种过程和多样化的血统，这对于构建高分辨率的关联图谱至关重要。由于现有棉花品种的遗传基础有限且主栽品种的多样性减少，自然群体中的原始种质资源，尤其是那些包含有益性状和优势基因的，成为了增强遗传多样性和推动进一步科研工作的重要资源。 因此，该研究不仅提供了关于棉花种质资源遗传多样性的深入了解，也为后续的群体遗传结构分析和数量性状位点的高分辨率关联研究奠定了基础。通过利用全基因组的SSR标记，科学家能够更好地挖掘棉花种质的遗传潜力，为棉花育种和遗传改良提供有力支持。