MATLAB与R实现局部皮层图球面旋转置换工具

资源摘要信息:"二抽取代码MATLAB-rotate_parcellation:代码（在Matlab和R中）以执行局部皮质贴图的球面旋转（置换）" 知识点详细说明: 1. MATLAB和R语言编程应用: 该资源涉及在两个不同编程环境中实现特定算法的经验。具体来说，它提供了在Matlab和R中执行局部皮质图的球面旋转的代码。Matlab是一种广泛用于数值计算、可视化以及编程的高性能语言和交互式环境。而R是一种专门用于统计分析和图形表示的编程语言。在此背景下，我们可以了解到，相同算法在不同编程环境中的实现差异以及每种环境的特定用途。 2. 球面旋转（置换）技术: 资源中提到的“球面旋转（置换）”是一种用于大脑图像分析的技术，尤其是在大脑皮层图谱分析中。这种技术允许研究者对皮质区域的位置进行旋转操作，以便进行更深入的统计分析和比较。这种操作通常用于校正因偶然因素引起的皮层分布差异，并帮助识别具有统计学意义的皮层区域。 3. Freesurfer软件和坐标系统: 提及的Freesurfer坐标系统是与该代码相关的一个重要概念。Freesurfer是一种广泛使用的软件工具，用于分析脑结构。它提供了精确的大脑皮层表面重建，包括皮层图谱的创建和分析。代码使用Freesurfer球面坐标作为输入，这些坐标表示了大脑皮层的不同区域。 4. HCP（人类连接组计划）分类: HCP分类在此资源中被引用，这涉及到大脑皮层区域的组织和分类方法。人类连接组计划旨在提供高分辨率的大脑结构和功能图谱，为神经科学研究提供了一个重要的基础。代码利用HCP分类提供的360个区域进行皮层分析。 5. 空间置换测试: 在描述中提到的“空间置换测试”是统计学中的一种方法，用于测试两个脑图像之间是否存在显著的空间差异。这是一种非参数检验方法，通常用于比较两组数据的分布是否有显著不同。在该资源中，空间置换测试可能与旋转排列技术结合，以评估不同皮层图谱之间的比较结果。 6. centroid_extraction_sphere函数: 资源中提及的另一个重要组件是Matlab函数centroid_extraction_sphere，该函数负责从Freesurfer的annot文件中提取任何拼合区域的质心坐标。这对于分析和处理大脑皮层结构至关重要，尤其是在需要精确地定位和分析特定大脑区域时。 7. Spearman相关分析: 在描述中提到的Spearman相关类型，是一种非参数的相关分析方法，用于评估两个变量之间的关联程度。在此资源中，Spearman相关分析被应用于比较不同的皮层图，以便研究者可以识别大脑皮层结构之间的统计相关性。 8. 系统开源标签: 资源标记为“系统开源”意味着该代码及其相关文件是开放源代码，用户可以自由获取和修改源代码。这种做法鼓励了透明性和可重复性，允许研究者社区共同改进算法并验证发现。 9. 文件名称列表“rotate_parcellation-master”: 最后，文件名称列表表明用户可以下载包含在名为rotate_parcellation-master的压缩包中的所有相关文件。这暗示了一个代码库的结构，其中包含了“master”分支，表明用户可获得最新版本的代码和相关功能。 综上所述，该资源为研究者提供了一套完整的工具，用于在Matlab和R中执行和分析大脑皮层图的球面旋转和置换。这些工具可用于进一步的研究和开发，并可作为神经科学和医学成像领域的宝贵资源。