GPU直通技术在OpenStack中的详细设计

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"GPU云服务器特性详细设计,包括GPU直通技术在云计算环境中的应用,主要涉及Linux系统和OpenStack平台。" GPU云服务器利用GPU直通技术,能够提供高性能的图形处理能力,使得虚拟机(VM)可以直接访问并控制物理主机上的GPU设备,避免了传统的通过操作系统(OS)层进行设备模拟的性能损耗。这一特性对于需要高性能计算和图形渲染的应用场景,如深度学习、科学计算、3D建模等,具有重要意义。 GPU直通,又称为GPUpass-through,它允许GPU设备绕过操作系统,直接与虚拟机通信,实现接近物理硬件的性能。这一技术的关键在于I/O内存管理单元(IOMMU),它能确保设备访问的安全性和隔离性。在启用IOMMU后,需要对系统进行一系列配置,例如在GRUB配置文件中添加相应的参数,以开启Intel IOMMU,并允许不安全的中断。 在Linux环境下,为了消除与GPU直通不兼容的开源NVIDIA驱动Nouveau,需要在`/lib/modprobe.d/dist-blacklist.conf`文件中禁用它,并设置NVIDIA驱动的modeset选项为0。此外,由于GPU直通的特性,一些操作可能无法支持,比如虚拟机的热迁移、实时大小调整(live-resize)和resize。 在OpenStack环境中,管理员需要配置系统以支持PCI直通。这通常涉及到配置Nova(OpenStack的计算服务)以识别和分配GPU设备给特定的虚拟机。租户可以通过OpenStack的API或Horizon控制台来创建和管理这些具有GPU直通功能的虚拟机。 为了实现GPU直通,需要考虑以下步骤: 1. 检查硬件支持:确认服务器是否支持IOMMU,并正确配置BIOS或UEFI设置。 2. 配置Linux内核:更新GRUB配置,启用IOMMU,并禁用可能导致冲突的驱动。 3. 安装并配置NVIDIA驱动:确保安装的是与GPU硬件兼容且支持直通的驱动。 4. 配置OpenStack:更新Nova配置文件,指定哪些GPU设备可以被直通给虚拟机。 5. 创建虚拟机:在创建虚拟机时,指定使用直通的GPU设备。 在部署GPU直通时,需要注意的是,这种技术增加了系统的复杂性,需要谨慎操作以避免数据丢失或系统不稳定。同时,由于不支持热迁移,需要计划性的维护窗口来确保服务的连续性。 GPU直通技术在云计算环境中提供了强大的硬件资源利用率,尤其对于GPU密集型应用,它提供了物理机器般的性能体验。然而,这也需要系统管理员具备深入的硬件、软件和虚拟化技术知识,以确保系统的稳定性和安全性。

data_dir='/public/work/Personal/wuxu/qiantao_17' for file1 in ${data_dir}/*.fasta; do for file2 in ${data_dir}/*.fasta; do if [ "$file1" != "$file2" ]; then touch snp_indel.end.sh && cat snp_indel.end.sh && \ export PATH=/public/work/Personal/pangshuai/software/conda/miniconda3/bin/:${PATH} && \ nucmer --mum -t 8 -g 1000 -p ${file1##*/}.${file2##*/}.ref_based.nucmer $file1 $file2 && \ delta-filter -1 -l 200 ${file1##*/}.${file2##*/}.ref_based.nucmer.delta > ${file1##*/}.${file2##*/}.ref_based.nucmer.delta.filter && \ dnadiff -d ${file1##*/}.${file2##*/}.ref_based.nucmer.delta.filter -p ${file1##*/}.${file2##*/}.ref_based.nucmer && \ show-coords -rcloT ${file1##*/}.${file2##*/}.ref_based.nucmer.delta.filter > ${file1##*/}.${file2##*/}.ref_based.nucmer.delta.filter.coords && \ show-coords -THrd ${file1##*/}.${file2##*/}.ref_based.nucmer.delta.filter > ${file1##*/}.${file2##*/}.ref_based.nucmer.delta.filter.syri.coords && \ show-snps -ClrTH ${file1##*/}.${file2##*/}.ref_based.nucmer.delta.filter > ${file1##*/}.${file2##*/}.ref_based.nucmer.delta.filter.snp && \ show-diff ${file1##*/}.${file2##*/}.ref_based.nucmer.delta.filter > ${file1##*/}.${file2##*/}.ref_based.nucmer.delta.filter.inv && \ perl /public/work/Pipline/Structural_Variation/pipeline/2.1.1/bin/filter_the_MUmmer_SNP_file.pl ${file1##*/}.${file2##*/}.ref_based.nucmer.delta.filter.snp ${file1##*/}.${file2##*/}.ref_based.nucmer.delta.filter.snp.SNPs ${file1##*/}.${file2##*/}.ref_based.nucmer.delta.filter.snp.Insertions ${file1##*/}.${file2##*/}.ref_based.nucmer.delta.filter.snp.Deletions 10000000 && \ touch snp_indel.end.tmp && \ mv snp_indel.end.tmp snp_indel.end && \ sleep 10 fi done done ,增加一个判断,使/public/work/Personal/wuxu/qiantao_17路径下以.fasta结尾的文件两两一组不分前后只组合一次,然后再执行touch 后面的代码

2023-06-03 上传