winQTLCart2.0：QTL定位与关联分析新方法应用

本文主要讨论了在作物遗传育种领域中，基于分子标记技术的QTL (数量性状基因) 研究的最新进展，特别是在使用winQTLCart2.0软件进行QTL分析时采用的一种创新方法——关联分析。QTL定位是通过分析标记基因型与数量性状值之间的连锁关系来确定基因在染色体上的位置及其影响。传统的QTL定位过程通常涉及构建适当的分离群体，收集群体的表型数据（如产量、抗病性等）和基于分子标记的基因型数据，然后运用统计分析来寻找标记与性状之间的关联。 winQTLCart2.0是一款功能强大的QTL分析软件，其流程包括数据预处理、软件运行、基因定位和分析，以及最终的遗传图谱绘制。该软件简化了复杂的分析步骤，使得研究人员能够高效地进行QTL研究。然而，传统的QTL定位方法可能会受到假阳性结果的影响，因为它依赖于标记和性状的直接关联性。 关联分析作为一种新方法，利用不同基因座等位变异之间的连锁不平衡关系，即非随机的基因连锁现象，来挖掘和定位那些与特定目标性状相关的基因或染色体区段。这种方法能够提高定位的特异性，减少假阳性，从而更加精确地识别出对作物数量性状有显著影响的关键基因或区域。关联分析的优势在于它能够从复杂的遗传背景中筛选出真正重要的遗传变异，这对于作物改良和育种工作具有重要意义。 文章作者王竹林、刘曙东和奚亚军来自西北农林科技大学农学院，他们强调了关联分析在QTL研究中的应用潜力，并将其作为QTL定位软件winQTLCart2.0的重要组成部分。文章还提到了分类号S188和Q-31，文献标识码A，以及文章编号0517-6611(2014)31-10858-03，这表明该研究发表在某科学期刊上，为作物遗传学领域的专业人士提供了实用的工具和理论指导。 这篇论文不仅介绍了winQTLCart2.0软件的使用，还探讨了如何利用关联分析这一新兴方法提升QTL研究的效率和准确性，对于农作物遗传育种实践具有重要的参考价值。