Shelxtl 5:原子表与最小二乘约束——结构分析指南

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Shelxtl 5 是一款专门用于结构分析的软件,由Sheldrick G. M. 在德国哥廷根大学开发。该软件的主要版本包括Shelx86、Shelx93、Shelx97以及最新的SHELXTL 5.*,支持MSDOS、UNIX和NT操作系统。Shelxtl 5 的功能模块丰富,主要包括数据校正(SADABS)、数据处理(XPREP)、结构解释(XS)、结构图形(XP)、结构修正(XL)和结构报告生成(XCIF)。 在使用Shelxtl 5 进行分析时,软件操作的核心是通过命令文件(.ins)进行指令输入,这些指令以四个字符的字符串形式定义,例如原子表的设置、空间位置调整(MOVE、EQIV)、各向异性温度因子处理(ANIS)、约束操作(AFIX)、原子间距固定(DFIX)和等价构型修正(SAME)。原子表中的格式详细描述了每个原子的名称、类型占有率、坐标以及可能的U矩阵元素,对于固定占有率的原子,使用sof值表示。 SADABS模块负责对衍射数据进行经验吸收校正,即根据等效点来校正因晶体形状引起的误差,这一步骤对确保数据质量至关重要。数据处理流程涉及从原始的CCD数据(*1.RAW)开始,经过SADABS校正后生成校正结果文件(*.abs),同时还会输出精修过的衍射点文件(*.hkl)以及矩阵文件(*.p4p)。 XPREP负责数据预处理,处理过程涉及用户配置文件(.prp)、命令文件(.ins)、原始数据文件(.hkl)和可能的首选文件(.pcf)。XS模块则用于结构解析,XL用于结构优化,而XCIF用于生成CIF格式的结构报告,以便与其他科研人员共享。 XP模块提供了结构图形界面,使得用户可以直观地查看和分析结构模型。此外,Shelxtl 5 还包含了实验数据的处理和控制文件,如SAINT记录数据处理进度,以及帧数据(*.raw)和CCD校正后的原始数据文件。 在实验室环境下,数据存储地址通常是局域网内的192.168.0.52,可以通过双TCP/IP协议进行访问,登录名、组名和密码需要用户输入。通过这些步骤,Shelxtl 5 提供了一套完整的结构分析工具链,帮助研究人员高效地进行晶体结构解析和优化工作。