NCBI GenBank:生物信息学中的核酸序列数据库

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"该资源为PPTX文件,主要介绍了NCBI(美国国立生物技术信息中心)站点及其重要资源库GenBank的相关信息,包括GenBank的建立背景、功能、数据来源、分类方式以及如何访问和查询GenBank中的序列数据。此外,还提及了遗传密码、Entrez Nucleotides查询系统和BLAST序列比对工具的使用。" NCBI(美国国立生物技术信息中心)是全球领先的生物信息学研究机构,提供一系列生物医学和遗传学相关的数据库和服务。其中,GenBank是一个庞大的、不断更新的基因序列数据库,由NCBI维护,旨在收集并注释所有公开的核酸序列。这个数据库是国际核苷酸序列数据库合作组织的成员,与日本的DDBJ和欧洲的EMBL共同运营,确保数据的全球共享和同步。 GenBank的记录涵盖了各种生物体的DNA和RNA序列,每个记录都包含连续的序列片段,以及详细的注释信息,如编码区(CDS)、蛋白质翻译等。序列按照不同的标准进行分类,如系统发生学关系或直接提交的数据。研究人员和科学家可以使用GenBank的accession number、作者、物种名、基因或蛋白质名称等关键词进行查询。 为了方便用户,NCBI开发了Entrez Nucleotides查询系统,这是一个综合检索工具,允许用户以多种方式查找和访问GenBank中的数据。此外,BLAST(Basic Local Alignment Search Tool)是另一项重要的服务,用于快速比较和查找序列间的相似性。用户可以通过电子邮件、Query服务器或FTP下载的方式与这两个系统交互,获取或分析序列数据。 GenBank记录的结构包括多个字段,如序列本身、序列长度、注释信息、生物体信息、提交者信息等,这些信息对于生物学家进行基因功能研究、进化分析以及疾病基因定位等至关重要。通过深入理解和有效利用这些资源,科研人员能够推进生物学和医学领域的研究进展。