生物信息学入门:Perl实战指南

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《初学者生物信息学Perl指南》(Beginning Perl for Bioinformatics)由James Tisdall所著,由O'Reilly出版社于2001年10月首次发行,拥有ISBN:0-596-00080-4,共384页。本书是专为那些对编程经验有限或无经验的生物学家量身打造的,它介绍了如何使用Perl语言进行生物数据的分析,Perl因其在生物信息学领域的理想特性而备受推崇。 本书的核心目标是教授生物学家基本的编程技能,通过解决特定问题或类别问题的方式学习。读者将不仅掌握Perl的基础知识,还将学会解析BLAST和GenBank等生物数据库工具,以及处理更高级生物信息学编程挑战所需的技能。作者以实用为导向,确保每个章节都专注于一个具体的任务或概念,帮助读者在阅读过程中逐步积累实际操作能力。 书中分为两个主要部分:生物学与计算机科学基础,以及Perl编程入门与实践。 第一部分涵盖了生物学基础知识,如DNA和蛋白质的组织结构、计算机模拟(In Silico)研究以及计算能力的局限性。这些章节旨在让读者了解生物信息学的背景,并为其后续学习提供必要的理论基础。 第二部分则深入到Perl语言的学习,包括了编程的初始阶段。作者强调了Perl语言的优势,比如其简单易学且功能强大的特性,以及适合生物数据处理的特性。随后的章节指导读者如何在自己的计算机上安装Perl,运行Perl程序,以及选择合适的文本编辑器以提高编程效率。此外,还提供了寻找帮助和解决问题的方法,以应对学习过程中的困惑。 此外,作者还讨论了不同的编程方法论,鼓励个体根据自己的需求和学习风格采取适当的编程策略。这表明本书不仅关注技术细节,也注重培养良好的编程习惯和思维技巧。 《初学者生物信息学Perl指南》是一本实用的教程,适合任何希望通过Perl进入生物信息学领域的学习者,无论他们的编程背景如何。通过本书,读者不仅能掌握Perl语言,还能了解到如何将其应用到生物数据分析的实际场景中,从而推动他们在生物信息学领域的发展。