使用BiLSTM+CRF+BERT的实体关系抽取流水线

版权申诉
5星 · 超过95%的资源 2 下载量 80 浏览量 更新于2024-10-11 3 收藏 33KB ZIP 举报
资源摘要信息:"实体关系抽取Pipline方式,使用了BiLSTM+CRF+BERT模型" 在自然语言处理(NLP)领域,实体关系抽取是一个重要的研究方向,它旨在从文本中识别出实体(如人名、地点、组织等)以及这些实体之间的关系。实体关系抽取技术在许多应用场景中都有广泛的应用,例如知识图谱构建、问答系统、信息检索和文本挖掘等。 本项目使用了深度学习技术来实现实体关系抽取,通过一种流水线式(Pipline)的方法,将命名实体识别(NER)和关系分类两个任务分开处理,但又相互依赖,共同完成实体关系的抽取工作。 1. **BiLSTM+CRF模型**:在命名实体识别部分,项目选用了双向长短期记忆网络(BiLSTM)配合条件随机场(CRF)的结构。BiLSTM是一种常用于处理序列数据的深度学习模型,它可以捕捉句子中前后词语之间的关系,并且由于是双向的,因此可以同时捕获从左到右和从右到左的上下文信息。CRF是一种判别式模型,用于序列标注问题,它的优势在于能够考虑整个句子的标注序列,从而能够有效地利用上下文信息进行标注,并避免标签独立性假设的问题。 2. **BERT模型**:在实体关系抽取阶段,项目应用了BERT(Bidirectional Encoder Representations from Transformers)模型进行关系分类。BERT是一种基于Transformer架构的预训练语言模型,它通过在大量文本上进行双向预训练,能够生成语义上丰富的文本表示。这种表示可以捕捉单词的上下文含义,使得后续在特定任务(如实体关系分类)上的微调效果极佳。 3. **知识图谱**:实体关系抽取的结果是构建知识图谱的重要基础。知识图谱是一种语义网络,用于存储实体之间的关系,并可以用于各种基于知识的应用。在本项目中,实体关系抽取的输出可以作为知识图谱中的边,连接起各个实体作为节点,从而构成一个结构化的知识网络。 4. **效果评估**:描述中提到最终的效果比较好,这意味着整个流水线式的实体关系抽取模型能够准确地识别出文本中的实体及其相互之间的关系。良好的效果得益于模型选择和结构设计的合理性,也反映了BERT和BiLSTM+CRF在实体识别和关系分类任务中的有效性。 总结而言,本项目通过结合BiLSTM+CRF和BERT,以及采用流水线式模型的方法,成功实现了高效准确的实体关系抽取。这不仅展示了深度学习在NLP任务中的强大能力,也为知识图谱的构建提供了有力的技术支持。随着人工智能技术的不断进步,类似的研究和应用将越发成熟,极大地推动了信息处理和智能决策的发展。

data_dir='/public/work/Personal/wuxu/qiantao_17' for file1 in ${data_dir}/*.fasta; do for file2 in ${data_dir}/*.fasta; do if [ "$file1" != "$file2" ]; then touch snp_indel.end.sh && cat snp_indel.end.sh && \ export PATH=/public/work/Personal/pangshuai/software/conda/miniconda3/bin/:${PATH} && \ nucmer --mum -t 8 -g 1000 -p ${file1##*/}.${file2##*/}.ref_based.nucmer $file1 $file2 && \ delta-filter -1 -l 200 ${file1##*/}.${file2##*/}.ref_based.nucmer.delta > ${file1##*/}.${file2##*/}.ref_based.nucmer.delta.filter && \ dnadiff -d ${file1##*/}.${file2##*/}.ref_based.nucmer.delta.filter -p ${file1##*/}.${file2##*/}.ref_based.nucmer && \ show-coords -rcloT ${file1##*/}.${file2##*/}.ref_based.nucmer.delta.filter > ${file1##*/}.${file2##*/}.ref_based.nucmer.delta.filter.coords && \ show-coords -THrd ${file1##*/}.${file2##*/}.ref_based.nucmer.delta.filter > ${file1##*/}.${file2##*/}.ref_based.nucmer.delta.filter.syri.coords && \ show-snps -ClrTH ${file1##*/}.${file2##*/}.ref_based.nucmer.delta.filter > ${file1##*/}.${file2##*/}.ref_based.nucmer.delta.filter.snp && \ show-diff ${file1##*/}.${file2##*/}.ref_based.nucmer.delta.filter > ${file1##*/}.${file2##*/}.ref_based.nucmer.delta.filter.inv && \ perl /public/work/Pipline/Structural_Variation/pipeline/2.1.1/bin/filter_the_MUmmer_SNP_file.pl ${file1##*/}.${file2##*/}.ref_based.nucmer.delta.filter.snp ${file1##*/}.${file2##*/}.ref_based.nucmer.delta.filter.snp.SNPs ${file1##*/}.${file2##*/}.ref_based.nucmer.delta.filter.snp.Insertions ${file1##*/}.${file2##*/}.ref_based.nucmer.delta.filter.snp.Deletions 10000000 && \ touch snp_indel.end.tmp && \ mv snp_indel.end.tmp snp_indel.end && \ sleep 10 fi done done ,增加一个判断,使/public/work/Personal/wuxu/qiantao_17路径下以.fasta结尾的文件两两一组不分前后只组合一次,然后再执行touch 后面的代码

2023-06-03 上传