MPICH2安装步骤与MPI基础教程
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更新于2024-09-15
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"MPICH2安装教程与MPI基础介绍"
MPICH2是Message Passing Interface (MPI)的一个实现,它是一个开源的、可移植的、高性能的并行计算库,允许程序员在多处理器系统上编写并行应用程序。MPI是并行编程的一种标准接口,提供了丰富的通信模式和数据类型,便于开发分布式内存的并行程序。
### MPICH2的安装步骤
1. **下载MPICH2包**:首先,你需要从官方或者其他可靠的源下载MPICH2的源代码包,例如`mpich2.tar.gz`。
2. **解压缩**:使用`tar`命令解压缩下载的文件,如`tar xvfz mpich2.tar.gz`。
3. **创建安装目录**:在适当的位置创建一个目录,例如`mkdir /tmp/root/mpich2-1.0.8`,用于存放编译构建过程中的文件。
4. **进入解压后的目录**:`cd /tmp/root/mpich2-1.0.8`。
5. **配置MPICH2**:运行`configure`脚本进行配置,指定安装位置,例如`/root/Desktop/mpich2-1.0.8/configure --prefix=/usr/local 2>&1 | tee configure.log`。
6. **编译源码**:使用`make`命令编译源码,将输出重定向到`make.log`,即`make 2>&1 | tee make.log`。
7. **安装MPICH2**:执行`make install`将编译好的二进制文件安装到指定目录,同时输出到`install.log`,即`make install PACKAGE=mpich-1.0.8 2>&1 | tee install.log`。
8. **检查安装**:运行`make installcheck PACKAGE=mpich-1.0.8 2>&1 | tee installcheck.log`以确保安装成功。然后,通过`which`命令检查`mpiexec`、`mpd`、`mpicc`和`mpirun`等关键程序是否已经添加到PATH环境变量中。
9. **设置环境变量**:如果安装目录不是默认的`/usr/local`,需要在用户的`.bashrc`文件中添加MPICH2的bin路径,例如`PATH="$PATH:/usr/MPICH-install/bin"`。
10. **配置mpd**:为了安全,需要在`~/.mpd.conf`文件中设置密码,并确保只有所有者有读写权限。
11. **单机测试**:启动`mpd`服务,使用`mpdtrace`检查节点状态,然后使用`mpiexec`运行简单的并行程序,如`mpiexec -n 1 /bin/hostname`。
12. **SSH配置**:为了在多台机器上运行MPI程序,需要确保所有节点的`/etc/hosts`文件中包含了所有节点的IP和主机名映射。同时,设置SSH无密码登录,可以通过在每台机器上生成SSH密钥对,并在所有节点间交换公钥。
### MPI基础知识
MPI提供了一组函数,用于在并行环境中进行进程间的通信,包括点对点通信(如`MPI_Send`和`MPI_Recv`)和集合通信(如`MPI_Bcast`和`MPI_Reduce`)。MPI程序通常由多个进程(rank)组成,这些进程可以分布在不同的计算节点上。
- **进程管理器(Process Manager)**:MPD是MPICH2中的进程管理器,负责启动和管理MPI进程。
- **MPI初始化和终止**:`MPI_Init`和`MPI_Finalize`分别用于初始化和结束MPI环境。
- **进程间通信**:`MPI_Send`和`MPI_Recv`用于发送和接收消息;`MPI_Bcast`用于广播数据;`MPI_Reduce`用于对数据进行聚合操作,如求和、最大值等。
- **进程间同步**:`MPI_Barrier`用于同步所有进程,确保所有进程在同一时刻执行特定操作。
- **进程排名和群组**:每个进程都有一个唯一的排名(rank),而`MPI_Comm_group`和`MPI_Group`可以用来定义和操作进程组。
- **文件操作**:MPI也支持并行文件操作,如`MPI_File_open`和`MPI_File_close`。
在掌握MPI和MPICH2的基础知识后,开发者可以编写并行应用程序,利用多处理器系统提供的计算能力,解决大规模计算问题。
2013-03-07 上传
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WandouChris
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