利用互信息最大化进行多模态医学图像配准

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"maesmiimageregpdf-maes_mi_image_reg.pdf——使用互信息最大化的多模态医学图像配准" 这篇论文"Multimodality Image Registration by Maximization of Mutual Information"发表在1997年4月的IEEETRANSACTIONSONMEDICALIMAGING期刊第16卷第2期,作者包括Frederik Maes、Andr´e Collignon、Dirk Vandermeulen、Guy Marchal和Paul Suetens,他们都是IEEE的成员。论文主要探讨了一种新的多模态医学图像配准方法,利用信息论中的基本概念——互信息(Mutual Information, MI)或相对熵,作为图像配准的新匹配标准。 互信息是一种度量两个随机变量之间相互依赖程度的指标,它在统计上衡量了两个图像对应体素强度之间的信息冗余。在几何对齐的理想情况下,如果两幅图像匹配,这种冗余通常达到最大值。该方法的优点在于,它不假设这种依赖关系的性质,并且不对涉及的模态图像内容施加任何限制性约束,因此具有广泛的适用性和强大的配准能力。 论文通过与立体定向注册的比较,验证了互信息准则在刚体配准中的准确性。具体实验涵盖了计算机断层扫描(CT)、磁共振成像(MRI)以及正电子发射断层扫描(PET)图像的配准。这种方法的准确性和有效性通过实际数据进行了验证,证明了其在解决多模态医学图像配准问题上的潜力。 在医学图像处理领域,配准是关键步骤之一,因为它允许不同成像技术的数据融合,从而提供更全面的解剖结构或生理功能信息。例如,CT图像可以提供良好的解剖结构细节,而MRI则擅长显示软组织对比,PET则能反映生物代谢活动。通过互信息最大化的配准,这些不同模态的图像可以有效地结合,提升诊断和治疗决策的精度。 论文进一步可能讨论了计算互信息的算法实现,以及优化过程以找到最佳配准参数。此外,可能还包含了对不同图像配准技术的比较,以及对配准误差的分析和评估方法。这种方法的创新性在于引入了一个通用的、不受特定图像特征限制的配准准则,为多模态医学图像分析开辟了新的路径。

UnpicklingError Traceback (most recent call last) Input In [66], in <cell line: 36>() 30 Kcat_model = model.KcatPrediction(device, n_fingerprint, n_word, 2*dim, layer_gnn, window, layer_cnn, layer_output).to(device) 31 ##‘KcatPrediction’是一个自定义模型类,根据给定的参数初始化一个Kcat预测模型。使用了上述参数,如果要进行调参在此处进行 32 # directory_path = '../../Results/output/all--radius2--ngram3--dim20--layer_gnn3--window11--layer_cnn3--layer_output3--lr1e-3--lr_decay0/archive/data' 33 # file_list = os.listdir(directory_path) 34 # for file_name in file_list: 35 # file_path = os.path.join(directory_path,file_name) ---> 36 Kcat_model.load_state_dict(torch.load('MAEs--all--radius2--ngram3--dim20--layer_gnn3--window11--layer_cnn3--layer_output3--lr1e-3--lr_decay0.5--decay_interval10--weight_decay1e-6--iteration50.txt', map_location=device)) 37 ##表示把预训练的模型参数加载到Kcat_model里,‘torch.load’表示函数用于文件中加载模型参数的状态字典(state_dict),括号内表示预训练参数的文件位置 38 predictor = Predictor(Kcat_model) File ~/anaconda3/lib/python3.9/site-packages/torch/serialization.py:815, in load(f, map_location, pickle_module, weights_only, **pickle_load_args) 813 except RuntimeError as e: 814 raise pickle.UnpicklingError(UNSAFE_MESSAGE + str(e)) from None --> 815 return _legacy_load(opened_file, map_location, pickle_module, **pickle_load_args) File ~/anaconda3/lib/python3.9/site-packages/torch/serialization.py:1033, in _legacy_load(f, map_location, pickle_module, **pickle_load_args) 1027 if not hasattr(f, 'readinto') and (3, 8, 0) <= sys.version_info < (3, 8, 2): 1028 raise RuntimeError( 1029 "torch.load does not work with file-like objects that do not implement readinto on Python 3.8.0 and 3.8.1. " 1030 f"Received object of type "{type(f)}". Please update to Python 3.8.2 or newer to restore this " 1031 "functionality.") -> 1033 magic_number = pickle_module.load(f, **pickle_load_args) 1034 if magic_number != MAGIC_NUMBER: 1035 raise RuntimeError("Invalid magic number; corrupt file?") UnpicklingError: invalid load key, 'E'. 这个问题怎么解决

2023-07-14 上传