数据预处理是数据分析中的关键步骤,特别是在神经影像学领域,如SPM(Statistical Parametric Mapping)的使用。SPM5是一个建立在MATLAB平台上的工具,专门用于功能磁共振成像(fMRI)的数据处理。在这个流程中,首先确保SPM的安装和配置,通常将SPM安装在便于访问的位置,比如C盘的根目录下,并配置好MATLAB环境。
在进行数据导入时,需要选择正确的MR扫描文件,如SIEMENS的t1_mpr_ns_sag_p2_iso全脑解剖像和ep2d_bold_moco功能像扫描,以及使用经典的棋盘格视觉刺激。导入过程中,对于某些品牌的如Philips的数据可能存在兼容性问题,建议使用如mricroN的dcm2nii工具进行转换。
数据导入后,SPM会处理DICOM图像并生成.mat文件,通过添加特定前缀(如s和f)来标识解剖像和功能像。"Display"功能在此阶段非常重要,不仅可以查看转换后的图像,还能定义头部的空间参考,例如前联合和AC-PC连线,这对于后续的标准化步骤至关重要。
数据预处理主要包括以下几个环节:
1. **Realign(头动校正)**:由于扫描过程中被试头部难免会有运动,Realign功能会消除由头动引起的图像失真,通过在整个实验期间校正被试头部的运动轨迹,减少其对数据分析结果的影响。
2. **Slicetiming(时间点校正)**:考虑到不同层面扫描的时间差异,此步骤用于同步同一事件在所有层面的时间点,确保时间轴的一致性。
3. **Coregister(配准)**:将功能像与解剖像进行空间配准,确保功能信号的定位准确无误。
4. **Normalise(标准化)**:将所有被试的功能像映射到标准空间模板(如MNI空间),消除个体间的解剖差异,以便进行跨被试的比较。
5. **Smooth(平滑)**:通过卷积操作降低数据的空间分辨率和噪声,提高统计分析的稳定性和信噪比。
这些预处理步骤是数据分析的基础,它们的质量直接影响到后续的统计分析结果。熟练掌握和执行SPM的数据预处理流程,能够确保研究的准确性和可靠性。