MATLAB代码实现多细胞分析平台MAPPER果蝇机翼定量分析
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更新于2024-11-22
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资源摘要信息:"视频图matlab代码-MAPPER_Quantitative:这是用于工程研究的多细胞分析平台(MAPPER)果蝇机翼分析管道的存储库"
一、知识点概述:
MAPPER是一个由Notre Dame大学内部开发的多细胞分析平台,其主要功能是用于定量分析果蝇机翼的结构与形态。该平台特别针对工程研究领域,通过分析视频图像数据,可以提供关于果蝇机翼的详细定量信息。MAPPER平台的开源代码可以在MAPPER_Quantitative-main存储库中找到。
二、技术细节:
1. 开发背景:MAPPER平台是为了解决生物工程研究中关于多细胞生物特别是果蝇机翼形态分析的问题而开发的。它能够提供高精度的量化分析,帮助科研人员更好地理解细胞间的相互作用和组织发展。
2. 运行环境:MAPPER平台主要使用MATLAB语言编写。MATLAB是MathWorks公司开发的一款高性能数值计算和可视化软件,非常适合进行图像处理、数据分析等工作。因此,使用MAPPER进行视频图像分析时需要在拥有MATLAB环境的计算机上运行。
3. 功能特点:该平台主要通过处理视频图像,进行图像分割、特征提取等步骤,来实现对果蝇机翼形态的定量分析。此外,MAPPER还可能支持用户自定义分析流程,以及进行数据的可视化展示。
4. 操作流程:详细的操作指导手册可以在手稿文本的补充信息中找到。用户需要根据手册进行一系列操作来运行MAPPER平台。同时,该平台的使用可能需要一定的生物图像处理和MATLAB编程知识。
5. 用户支持:如果在使用MAPPER平台时遇到任何问题,用户可以直接联系实验室负责人获取技术支持。
三、资源致谢与资助信息:
1. 代码贡献者:MAPPER的发展离不开社区中各方的贡献。尤其是Ramezan Paravitorgabeh博士、Vijay Kumar Naidu Velagala博士、Megan Levis博士和Qinfeng Wu博士等专家的技术援助和科学讨论对项目的成功实施起到了关键作用。
2. 设备与资金支持:MAPPER平台的开发得到了包括NIH R35GM124935项目、NSF-CBET-1553826奖项、西北大学的NSF-Simons Pilot奖项、圣母大学国际墨西哥教师授予计划以及Concejo资助CB-014-01-23668等的支持。
四、开源社区与扩展性:
1. 开源标签:MAPPER_Quantitative-main存储库带有“系统开源”的标签,表明该项目是开放源代码的。在开源社区中,研究人员可以自由使用、修改并传播这些代码,从而加速科研进展和促进社区合作。
2. 扩展性:MAPPER平台可能具备一定的扩展性,科研人员可以根据自身需求进行定制开发,例如添加新的分析模块、改进现有算法或者优化用户界面。
五、结论:
MAPPER_Quantitative-main存储库是工程研究领域中的一个重要工具,尤其对于生物工程研究人员来说,它能够提供一种有效的手段来定量分析果蝇机翼。通过开源社区的支持和NIH、NSF等科研机构的资助,MAPPER平台有望持续发展并为全球科研工作做出更大的贡献。
2021-10-03 上传
2020-02-25 上传
2021-02-15 上传
2021-05-22 上传
2021-05-26 上传
2021-07-23 上传
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2021-06-16 上传
2021-04-27 上传
weixin_38543460
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