VBM5.1中文手册:数据预处理与分析指南
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更新于2024-09-12
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"vbm5.1-Manual"
vbm5是一款用于进行脑影像分析的工具,特别在结构磁共振成像(MRI)的体素基于形态学(Voxel-Based Morphometry, VBM)分析中被广泛使用。这个手册是vbm5的中文版,旨在帮助用户更直观、清晰地理解和操作这个软件。
1. 预处理
预处理是数据分析的重要步骤,它确保数据的质量和准确性。在vbm5中,首先需要设置工作目录。用户可以通过Utilities菜单选择CD,然后选择目标目录。选中的目录会显示在窗口底部,如果需要取消选择,只需点击其名称即可,最后点击“Done”。
2. 选择VBM5工具箱
在进行进一步分析前,用户需从Toolboxes菜单中选择vbm5。这样,vbm5.1会出现在第二个窗口中,准备进行后续操作。
3. 正则化、偏倚校正和分割
这是VBM分析的核心部分。在VBM5.1界面,用户可以执行以下步骤:
- 数据导入:通过Estimate and write功能,指定待处理的原始数据文件。这些文件会在窗口底部列出,若要取消选择,只需点击文件名。
- 估计选项:双击"+"展开选项,包括:
- 组织概率图:选择/Spm/spm5/tpm路径下的"grey.nii", "white.nii", "csf.nii"文件,分别对应灰质、白质和脑脊液的概率图。
- 模型类别的高斯分布:输入文本“2224”,这通常对应于3个组织类别的参数。
- 平移变换:选择“ICBM空间模板 – European”,这是一种常用的标准化模板。
- 变形平滑度:输入“1”,表示一定的变形平滑度。
- 变形频率截止:输入“25”,控制高频成分的抑制。
- 偏倚校正:选择“verylightregularization (0.0001)”以进行轻度的偏倚校正。
- 偏倚全宽半高值(FWHM):选择“70mmcutoff”,设定偏倚场的平滑程度。
- 采样距离:输入“3”,设置体素间的采样间隔。
- 掩模图像:用户还可以指定掩模文件,用于限制分析区域,通常使用灰质掩模。
这些步骤是vbm5.1进行VBM分析的基本流程,通过这些设置,可以将个体的MRI图像标准化到统一的空间模板,进行偏倚校正,以及对灰质、白质和脑脊液进行分割。这些处理有助于减少扫描间的变异性和提高统计分析的可靠性。后续的分析可能包括比较不同组间或同一组内不同时间点的脑形态差异,寻找潜在的病变区域或与特定行为或认知功能相关的脑区。
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