R语言常用程序包速查

需积分: 9 0 下载量 104 浏览量 更新于2024-09-03 收藏 8KB TXT 举报
"该文档列出了一系列在R软件中常用的程序包名称,这些包涵盖了数据分析、统计建模、可视化、机器学习等多个领域,是R语言生态的重要组成部分。" 在R软件中,程序包(Package)是扩展R功能的核心方式,它们提供了丰富的函数、数据集和编程工具,帮助用户更高效地进行数据分析和研究。以下是一些列在文档中的关键程序包及其主要功能: 1. **abind**:用于多维数组的并行绑定,类似于`cbind`和`rbind`,但适用于更高维度。 2. **ade4**:提供多元生态学数据分析方法,包括主成分分析、典范对应分析等。 3. **AER**:应用经济计量学,包含用于经济模型的估计和检验的工具。 4. **Amelia**:缺失数据的多重插补方法,支持不完全数据集的分析。 5. **animation**:用于创建动态图表和GIF,增强数据可视化的表现力。 6. **ape**:应用于生物进化分析,提供分子进化和系统发育树处理的工具。 7. **arules** 和 **arulesSequences**:规则挖掘和序列挖掘库,常用于市场篮子分析和行为模式识别。 8. **BH**:Boost库的R接口,提供C++的高效算法和数据结构。 9. **Biobase** 和 **BiocGenerics**:Bioconductor的基础包,为生物信息学提供通用函数。 10. **caret**:分类与回归训练,提供了大量预处理、模型选择和评估的函数。 11. **cluster**:聚类分析包,包含多种聚类算法。 12. **corrplot**:用于绘制相关矩阵的可视化工具。 13. **data.table**:快速、灵活且内存效率高的数据操作包,比内置的`data.frame`更强大。 14. **DBI**:数据库接口,为与数据库交互定义了一套标准的R函数。 15. **dbscan**:基于密度的空间聚类算法,用于发现任意形状的聚类。 16. **ggplot2**:虽然没有直接列出,但作为R中最著名的可视化库,其用于创建高质量的图形。 17. **tidyverse**系列:如`dplyr`(数据操作)、`tidyr`(数据整理)和`readr`(数据读取),提供了一套一致的语法来处理数据。 这只是文档中提到的众多包中的一小部分,每个包都有其独特的用途和价值,它们共同构成了R的强大生态系统,使得R成为数据分析和统计建模的首选工具。通过安装和使用这些包,用户可以执行从数据导入、清洗、转换、建模到报告生成的整个数据分析流程。
2018-04-28 上传
R软件的介绍 R是一个开放的统计编程环境,是一种语言,R语言是从S语言演变而来的。S语言是二十世纪70年代诞生于贝尔实验室,由Rick Becker, John Chambers, Allan Wilks开发。基于S语言开发的商业软件Splus,可以方便的编写函数、建立模型,具有良好的扩展性,取得了巨大成功。1995年由新西兰Auckland大学统计系的Robert Gentleman和Ross Ihaka,编写了一种能执行S语言的软件,并将该软件的源代码全部公开,这就是R软件,其命令统称为R语言。R是开源软件,代码全部公开,对所有人免费。R可在多种操作系统下运行,如Windows, Li~和UNIX等。R需要输入命令,可以编写函数和脚本进行批处理运算,语法简单灵活。目前在R网站上约有两千多个程序包,涵盖了基础统计学、社会学、经济学、生态学、地理学、医学统计学、生物信息学等诸多方面。 R的获取与安装 R诞生于the University of Auckland的统计系。The Comprehensive R Archive Network简称CRAM,提供下载安装程序和相应软件包。 R主页http://www.r-project.org/a下载:CRAM,选择镜像(如:http://cran.cnr.berkeley.edu/ ),选择操作系统(Linux,Windows或MacOS)。 以下简述R FOR WINDOWS的安装和使用: 在R主页下可以找到R的各个版本的安装程序和源代码。点击进入:Windows (95and later),再点击:base,下载SetupR.exe,约18兆,此便是R FOR WINDOWS的安装程序。双击SetupR.exe,按照提示一步步安装即可。 安装完成后,程序会创建R程序组并在桌面上创建R主程序的快捷方式(也可以在安装过程中选择不要创建)。通过快捷方式运行R,便可调出R的主窗口。 类似于许多以编程方式为主要工作方式的软件,R的界面简单而朴素,只有不多的几个菜单和快捷按钮。快捷按钮下面的窗口便是命令输入窗口,它也是部分运算结果的输出窗口,有些运算结果则会输出在新建的窗口中。 主窗口上方的一些文字是刚运行R时出现的一些说明和指引。 文字下的:>符号便是R的命令提示符,在其后可输出命令;>后的矩形是光标。R一般是采用交互方式工作的,在命令提示符后输入命令,回车后便会输出结果。 在R朴素的界面下,是丰富而复杂的运算功能。 附加包的安装 install. packages(package name, dependencies=TRUE) Windows下可以用菜单Packages--} Install package(s)安装 版本的更新 主程序:Windows下面只能卸载再安装 程序包:update.packages() RStudio R语言可以独立运行,但是Rstudio作为R附加的GUI,有效的划分功能区,使输入和输出更为方便。 RStudio是可以在Mac OS X, Linux和Windows上运行在R编程语言中的生产力和灵活的用户界面。是一个自由和开源编程语言和环境,提供了大量的图形和统计方法统计计算和图形。从中可以快速方便地访问各种生产力工具的面向用户的界面。RStudio是一个非常实用的R语言的IDE,是一个免费的软件,特别是其服务器软件,可以将其构建在Linux服务器上,然后通过远程网页登陆访问,使得R语言的使用获得了极大的方便,也可以说是一个小小的云服务。