中国柿属植物物种鉴定：cpDNA与nrDNA序列的综合分析

本文主要探讨了基于细胞质DNA (cpDNA) 和核DNA (nrDNA) 序列对中国柿属植物隐存种进行鉴别的方法。研究由唐冬兰、郭玲、徐莉清、张青林和罗正荣等专家合作完成，他们利用高等校博士学科点专项科研基金的支持（编号20110146110018），针对35种柿属植物的200份样本进行了细致的分析。 研究选取了三个质体片段（matK、rbcL和ndhF）以及两个核基因区域（ITS和ITS2）作为潜在的DNA条形码。结果显示，除少数几份样本外，大部分质体片段如matK、rbcL和ndhF通过直接测序得到了双向序列，显示出较高的测序成功率。然而，核基因片段ITS和ITS2的测序成功率较低，分别在86份（40.95%）和134份（63.81%）样本中成功获取。 在生物信息学分析中，发现单个片段中，ITS在物种内部聚类方面表现最优，能够有效地将同种样本归类。结合多个片段的测序数据集，matK+ITS组合表现出最好的物种鉴定效果，其次是ndhF+ITS和matK+ndhF。考虑到序列获取的便捷性、鉴定效率以及成本效益，matK+ndhF被推荐作为柿属植物的主要条形码，而matK+ITS或ndhF+ITS则作为备选方案。 文章的关键词包括DNA条形码、ITS、matK、rbcL、ndhF、柿属植物和柿科，体现了研究的焦点和应用领域。通过对这些基因区域的综合分析，研究者们旨在为柿属植物的物种鉴定提供更为准确和实用的分子标记，对于植物分类学和遗传多样性研究具有重要意义。此外，这项工作也为其他类似植物物种的分类提供了参考方法。