丹参锚蛋白基因克隆与表达谱分析
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更新于2024-08-12
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本文报道了2013年发表在《陕西师范大学学报(自然科学版)》的一篇关于丹参锚蛋白重复序列家族基因(SmARP)克隆和表达的研究。通过降落PCR技术,研究人员成功地获得了这种基因的克隆,并进行了深入的生物信息学分析。SmARP编码的蛋白质具有19,064 kDa的分子量,理论等电点为8.4,这表明它是一个不稳定且不具备信号肽和跨膜区的蛋白。
二级结构分析揭示了SmARP蛋白的主要构成,大约有39.64%的α螺旋和42.01%的无规则卷曲,这种二级结构有助于理解其功能特性。更进一步,三维结构模型描绘出每个锚蛋白重复序列折叠成两个反向平行的α螺旋,每个α螺旋之间形成一个长环,这种特殊的结构可能与其生物学功能密切相关。
值得注意的是,该研究还通过实时荧光定量PCR技术,证实了SmARP基因在丹参的不同组织中都有表达,包括根、茎、叶和花,这暗示了该基因可能在植物生长发育或特定生理过程中扮演重要角色。这些发现对于理解丹参的生物学过程以及锚蛋白重复序列家族基因在植物中的作用具有重要意义,可能为未来的药用植物资源开发和基因功能研究提供新的线索。
关键词:丹参、锚蛋白重复序列家族基因、生物信息学分析,表明这项研究不仅限于基础科学层面,也对中药学和分子生物学的实际应用有所贡献。通过将遗传学方法与生物信息学相结合,研究者们能够揭示植物基因的功能特性及其在生态系统中的作用,为植物资源管理和利用提供了科学依据。
2020-02-10 上传
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