优化的位并行算法:序列模式匹配与通配符
"A BIT-PARALLEL ALGORITHM FOR SEQUENTIAL PATTERN MATCHING WITH WILDCARDS" 是一篇研究论文,主要探讨了在模式匹配中处理包含空格约束和“一次错误”条件的问题,特别是在生物信息学、信息检索和字典查询等领域。SAIL算法是解决此类问题的最有效方法之一,但当模式较长时,其计算时间消耗较大。现有的基于位并行的算法无法处理连续两个通配符之间只有一个模式字符的情况,且对于最小局部长度约束为零的情况也无法妥善处理。 这篇论文由Dan Guo, Xiao-Li Hong, Xue-Gang Hua, Jun Gao, Ying-Ling Liu, Gong-Qing Wu和Xindong Wu共同撰写,发表于Taylor & Francis的《Cybernetics and Systems: An International Journal》上。论文的原始版本首次发布于2011年9月8日。 位并行算法是计算机科学中一种高效的数据处理技术,它利用计算机内部并行处理的能力来同时处理多位数据,从而提高运算速度。在本论文中,作者提出了一种新的位并行算法,旨在解决具有通配符的顺序模式匹配问题。通配符在模式匹配中通常代表可以匹配任意字符的位置,增加了匹配的灵活性,但同时也增加了复杂性。 传统的位并行算法可能无法有效地处理特定类型的模式,比如那些通配符间只间隔一个固定字符的模式。论文中提出的算法可能解决了这一局限性,使得在满足最小局部长度为零的情况下,也能进行高效的模式匹配。这对于处理大规模数据,如生物序列分析或大规模文本搜索,具有重要的实际意义。 论文详细介绍了新算法的设计原理、实现细节以及性能评估,可能包括理论分析和实验结果,展示了其在处理时间和空间效率上的优势。此外,论文还可能讨论了算法的优化策略,以及与其他现有算法的比较,以证明其优越性。 这篇论文为处理包含通配符的顺序模式匹配问题提供了一个创新的位并行解决方案,对于提升生物信息学、信息检索等领域的计算效率有着积极的贡献。
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